RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557654.5

GPHN-215, Transcript of gephyrin, human

TSL 4

Gene GPHN, Length 503 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPHN-215	ENST00000557654	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	CD302	Q8IX05	232 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	MREG	Q8N565	214 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	P3H4	Q92791	437 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ARSG	Q96EG1	525 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	RICTOR	Q6R327	1708 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	NFAT5	O94916	1531 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	NID2	Q14112	1375 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ABCC12	Q96J65	1359 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	C4A	P0C0L4	1744 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	C4B	P0C0L5	1744 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654		A0A1B0GUA9	196 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654		G3V2L1	256 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	NDUFAB1	O14561	156 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	CPLX1	O14810	134 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	GYPC	P04921	128 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	GHR	P10912	638 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ACHE	P22303	614 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	PDHA2	P29803	388 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	CASP14	P31944	242 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	KRT83	P78385	493 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	IRX4	P78413	519 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TEF	Q10587	303 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TOMM20	Q15388	145 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	SNCB	Q16143	134 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	CRY2	Q49AN0	593 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF774	Q6NX45	483 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	4.05	□□□□□ -1.76	2e-7	■■■■■ 64.2
GPHN-215	ENST00000557654	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF558	Q96NG5	402 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	GSDMA	Q96QA5	445 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	SLIT3	O75094	1523 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654		A0A1W2PPR1	153 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654		H0YHG0	523 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	HSF2BP	O75031	334 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	IGKV5-2	P06315	115 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	PAEP	P09466	180 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	HOXC13	P31276	330 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	RGS19	P49795	217 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	LIMK1	P53667	647 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	XRCC4	Q13426	336 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	RIPK1	Q13546	671 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	GCKR	Q14397	625 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	PTGIS	Q16647	500 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	TTMP	Q5BVD1	217 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	FCRLA	Q7L513	359 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	IQCK	Q8N0W5	287 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	METTL4	Q8N3J2	472 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GPHN-215	ENST00000557654	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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