RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 AP5B1Q2VPB7 878 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 TMEM35AQ53FP2 167 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 DEPDC1Q5TB30 811 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ABHD17BQ5VST6 288 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 FAM219BQ5XKK7 198 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 CHSY3Q70JA7 882 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ATCAYQ86WG3 371 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ACOT4Q8N9L9 421 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 L3MBTL4Q8NA19 623 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ARMC2Q8NEN0 867 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 M1APQ8TC57 530 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 NPAS2Q99743 824 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 CCDC77Q9BR77 488 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 TBCDQ9BTW9 1192 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ZBTB26Q9HCK0 441 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 MMP25Q9NPA2 562 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ASF1BQ9NVP2 202 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 KCMF1Q9P0J7 381 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 DAPP1Q9UN19 280 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 MMACHCQ9Y4U1 282 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 V9GYY5 206 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 A0A1B0GTL3 188 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 DYTNA2CJ06 578 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 CYR61O00622 381 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 PPP6CO00743 305 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 VPS4BO75351 444 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ETHE1O95571 254 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 RPS17P08708 135 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 TNFSF10P50591 281 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 RAP1GDS1P52306 607 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 CDH13P55290 713 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 TRAF3Q13114 568 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 TLR1Q15399 786 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 OR4C11Q6IEV9 310 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 CRLF3Q8IUI8 442 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 SCUBE1Q8IWY4 988 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ZNF595Q8IYB9 648 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 BEST3Q8N1M1 668 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 OR1N1Q8NGS0 311 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 RGMAQ96B86 450 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 REPS1Q96D71 796 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ROGDIQ9GZN7 287 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 LYRM4Q9HD34 91 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 STMN3Q9NZ72 180 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ADGRE2Q9UHX3 823 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 FBXW2Q9UKT8 454 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 VPS4AQ9UN37 437 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 CLDN16Q9Y5I7 305 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 SVILO95425 2214 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 SAGE2PA6NJ88 616 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 TCP11X1B4DZS4 312 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 CLDN4O14493 209 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 PLPP1O14494 284 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 DLX3O60479 287 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 EEDO75530 441 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 MYO1DO94832 1006 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 SCELO95171 688 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 TAC1P20366 129 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 HSD17B3P37058 310 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 TSFMP43897 325 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 HSD17B7P56937 341 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 PHEXP78562 749 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ID2Q02363 134 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 SLAMF1Q13291 335 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 RCN2Q14257 317 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 NR6A1Q15406 480 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 UNC50Q53HI1 259 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 SGO1Q5FBB7 561 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ACER2Q5QJU3 275 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 H3F3CQ6NXT2 135 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 MILR1Q7Z6M3 343 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 GALNT11Q8NCW6 608 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 OR4F6Q8NGB9 312 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 OR2W6PQ8NHA6 318 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 WDR20Q8TBZ3 569 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ACMSDQ8TDX5 336 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ELP5Q8TE02 316 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-214ENST00000490425 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms