RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 NPC1O15118 1278 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 SEMA3DO95025 777 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 ETHE1O95571 254 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 TGFBR1P36897 503 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 DDOSTP39656 456 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 SEPHS1P49903 392 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 RORCP51449 518 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 DSTNP60981 165 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 RPS13P62277 151 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 RUNX1T1Q06455 604 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 C1DQ13901 141 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 TSTQ16762 297 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 BCL7AQ4VC05 210 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 C12orf73Q69YU5 71 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 DPPA4Q7L190 304 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 COMMD6Q7Z4G1 85 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 TAGAPQ8N103 731 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 AQP11Q8NBQ7 271 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 SLAIN1Q8ND83 568 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 PROKR2Q8NFJ6 384 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 OR8J1Q8NGP2 316 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM80Q96HE8 168 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 PKP4Q99569 1192 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 SLX1AQ9BQ83 275 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 UCK2Q9BZX2 261 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 NEK6Q9HC98 313 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 ISYNA1Q9NPH2 558 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 RLIMQ9NVW2 624 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 NDUFB11Q9NX14 153 aa16.11■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 TRBC2A0A5B9 178 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 UPK3BL1B0FP48 263 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 UPK3BL2E5RIL1 263 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 TLR4O00206 839 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGAP33O14559 1287 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 SEC14L5O43304 696 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 CCNKO75909 580 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 C6orf47O95873 294 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 CKMP06732 381 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 ELNP15502 786 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 FUT4P22083 530 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 AQP1P29972 269 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 GJA8P48165 433 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 SEMG2Q02383 582 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 TXNDC8Q6A555 127 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 KLHL17Q6TDP4 642 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 CD300LDQ6UXZ3 194 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 SLC39A11Q8N1S5 342 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 CLDN22Q8N7P3 220 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 C16orf78Q8WTQ4 265 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 GLYATL1Q969I3 302 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 MED8Q96G25 268 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM169Q96HH4 297 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF558Q96NG5 402 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 OPALINQ96PE5 141 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 NLNQ9BYT8 704 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 NEUROD4Q9HD90 331 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 FBXL12Q9NXK8 326 aa16.1■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 HYKKA2RU49 373 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 A8MX80 341 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 IL1AP01583 271 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 C1QCP02747 245 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 GAAP10253 952 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 CTSAP10619 480 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 NUDT6P53370 316 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 OR2B6P58173 313 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 ZXDBP98169 803 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 COX10Q12887 443 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 MED22Q15528 200 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF385BQ569K4 471 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 COX20Q5RI15 118 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 ERAP2Q6P179 960 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 RAB43Q86YS6 212 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 NR4A3Q92570 626 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 NEURL3Q96EH8 262 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 OR2A14Q96R47 310 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 MED18Q9BUE0 208 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 ZSCAN32Q9NX65 697 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1W2PRB8 838 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 PRAMEF25A6NGN4 478 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 SLC16A8O95907 504 aa16.09■□□□□ 0.17
HCLS1-202ENST00000428394 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms