RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 RNF39Q9H2S5 420 aa13.22□□□□□ -0.29
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CTIF-202ENST00000382998 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa13.21□□□□□ -0.3
CTIF-202ENST00000382998 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa13.21□□□□□ -0.3
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CTIF-202ENST00000382998 LRRC52Q8N7C0 313 aa13.21□□□□□ -0.3
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