RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 ARL9Q6T311 187 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 KDELC1Q6UW63 502 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 TREML1Q86YW5 311 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR150Q8NGU9 434 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC106Q9BWC9 280 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 DEFB126Q9BYW3 111 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM184CQ9NVA4 438 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 CH25HO95992 272 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 HLA-DPB1P04440 258 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 FBLP22087 321 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGB7P26010 798 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 COLEC12Q5KU26 742 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXL8Q96CD0 374 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFP3Q96NJ6 502 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 BOCQ9BWV1 1114 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 MARCH7Q9H992 704 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 GJD2Q9UKL4 321 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC42Q9Y546 428 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 CHD4Q14839 1912 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 VSTM5A8MXK1 200 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ACOX3O15254 700 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 EDNRAP25101 427 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 NUDT6P53370 316 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 SMU1Q2TAY7 513 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 CARM1Q86X55 608 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC45A3Q96JT2 553 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 NCDNQ9UBB6 729 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 GRHPRQ9UBQ7 328 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PRQ8 180 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 HYKKA2RU49 373 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 EEDO75530 441 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 OR12D1P0DN82 309 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 KDELR2P33947 212 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 GABRA3P34903 492 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ARSFP54793 590 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 NKD1Q969G9 470 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 CMKLR1Q99788 373 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 GORASP1Q9BQQ3 440 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 UBAP1Q9NZ09 502 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 DKKL1Q9UK85 242 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 PCTPQ9UKL6 214 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 CSTAP01040 98 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 CEBPBP17676 345 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 HOXC13P31276 330 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 OR12D2P58182 307 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBED5Q49AG3 693 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ITPAQ9BY32 194 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 GRXCR1A8MXD5 290 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 AREL1O15033 823 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 AXIN1O15169 862 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 SOX14O95416 240 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 HK1P19367 917 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ECHS1P30084 290 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 GALK1P51570 392 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 HHEXQ03014 270 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 GRM7Q14831 915 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF542PQ5EBM4 170 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 COQ5Q5HYK3 327 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 C6orf89Q6UWU4 347 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC80Q76M96 950 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 MARCH9Q86YJ5 346 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 YIPF7Q8N8F6 280 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 THRSPQ92748 146 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 DOHHQ9BU89 302 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 CCNKO75909 580 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGEF15O94989 841 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 FOSL2P15408 326 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ACSL1P33121 698 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 DMPKQ09013 629 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF234Q14588 700 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 C15orf40Q8WUR7 153 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 TPSD1Q9BZJ3 242 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 MED28Q9H204 178 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 SOCS7O14512 581 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF208O43345 1280 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 TCTE1Q5JU00 501 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF111Q6ZNA4 994 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 MINDY1Q8N5J2 469 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC46A2Q9BY10 475 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 BRD7Q9NPI1 651 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PRG6 482 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 MUSKO15146 869 aa15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms