RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.96□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 J3QLW9 94 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RNF13O43567 381 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GALTP07902 379 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ACRP10323 421 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 G6PDP11413 515 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 BCKDHAP12694 445 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZNF19P17023 458 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 UGT1A6P19224 532 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 UGT1A1P22309 533 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 HMGCS1Q01581 520 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TGFBIQ15582 683 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 BORAQ6PGQ7 559 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PQLC3Q8N755 202 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 FAM110BQ8TC76 370 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TBX5Q99593 518 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 DOHHQ9BU89 302 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TMED9Q9BVK6 235 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 NUDT15Q9NV35 164 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SOBPA7XYQ1 873 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ITGB1P05556 798 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ITGA5P08648 1049 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 IFI30P13284 250 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PGCP20142 388 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CASP6P55212 293 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TLE2Q04725 743 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 FGL1Q08830 312 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RPA4Q13156 261 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GRM2Q14416 872 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CCL14Q16627 93 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 STEAP4Q687X5 459 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ARL9Q6T311 187 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 THEM6Q8WUY1 208 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 THAP4Q8WY91 577 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ACSS2Q9NR19 701 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 WDR45Q9Y484 360 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SH3D21A4FU49 640 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 NOTOA8MTQ0 251 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SLITRK5O94991 958 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 S1PR1P21453 382 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SLC15A1P46059 708 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 KLK6Q92876 244 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SCLYQ96I15 445 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RAD9AQ99638 391 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CENPMQ9NSP4 180 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PPL8 197 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 IFNA1P01562 189 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MT-ND1P03886 318 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MMP2P08253 660 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 FOSL1P15407 271 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 FDXRP22570 491 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PMS2P3Q13401 168 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MELKQ14680 651 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZNF404Q494X3 552 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OR2T33Q8NG76 320 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 DDIT4LQ96D03 193 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 C9JVG2 144 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RAD51DO75771 328 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 E2F1Q01094 437 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.95□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OGFOD2Q6N063 350 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms