RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000076372.4

Sf3b4-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b4, Length 1,915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ferd3lQ923Z4 168 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rnf144aQ925F3 292 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 SdhbQ9CQA3 282 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gkn2Q9CQS6 184 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CacybpQ9CXW3 229 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tomm70Q9CZW5 611 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Katnal2Q9D3R6 539 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 RgccQ9DBX1 137 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CalyQ9DCA7 226 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Myg1Q9JK81 380 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cep295Q8BQ48 2412 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Lama1P19137 3084 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm13420A0A140LJJ2 248 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Krt90E9Q1Z0 538 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CflarO35732 481 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mtx2O88441 263 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CalrP14211 416 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 GhrP16882 650 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 ThpoP40226 356 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 MtpnP62774 118 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cpxcr1Q3V0P1 322 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Grb10Q60760 621 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pdcd4Q61823 469 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 N4bp1Q6A037 893 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Znf629Q6A085 867 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rassf6Q80UQ2 353 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Csgalnact1Q8BJQ9 530 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gbp9Q8BTS3 619 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dock8Q8C147 2100 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Lrrc25Q8K1T1 297 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr689Q8VG18 320 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Asb9Q91ZT8 290 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Txndc9Q9CQ79 226 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Haus5Q9D786 619 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Sh2d4aQ9D7V1 421 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 TescQ9JKL5 214 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Uba2Q9Z1F9 638 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 FrylF8VQ05 3007 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 MgaA2AWL7 3003 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slc43a3A2AVZ9 502 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 RerglB2RVE2 204 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Alox8O35936 677 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Arf3P61205 181 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Aldh16a1Q571I9 802 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Usp22Q5DU02 525 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Itga2Q62469 1178 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Atp4aQ64436 1033 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Kyat3Q71RI9 455 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mfn1Q811U4 741 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fbxl4Q8BH70 621 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cyp20a1Q8BKE6 462 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slc26a9Q8BU91 790 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ikzf4Q8C208 586 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pramef8Q8CE24 480 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Utp6Q8VCY6 597 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr551Q8VG23 315 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Impa2Q91UZ5 290 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 SharpinQ91WA6 380 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 DhddsQ99KU1 333 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rnf111Q99ML9 989 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CygbQ9CX80 190 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fam162aQ9D6U8 155 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Lrrc69Q9D9Q0 347 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Acot2Q9QYR9 453 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn1r170K7N6W9 304 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn2r13L7N1X2 831 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 UgdhO70475 493 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CfpP11680 464 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rb1P13405 921 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cdh4P39038 913 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tnfsf9P41274 309 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cdx2P43241 311 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Hpcal1P62748 193 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Casp3P70677 277 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gspt2Q149F3 632 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ankdd1bQ14DN9 521 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slc23a3Q60850 611 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ppp1r1cQ8BKK4 108 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gramd1cQ8CI52 457 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 B3gnt7Q8K0J2 397 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Nrbf2Q8VCQ3 287 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Micu1Q8VCX5 477 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Smap1Q91VZ6 440 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pdk3Q922H2 415 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Oosp1Q925U0 202 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Nck1Q99M51 377 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 AenQ9CZI9 336 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 MtpapQ9D0D3 585 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tmem35aQ9D328 167 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 PrkraQ9WTX2 313 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn2r125D3Z3M1 369 aa14.68□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Coq10aE9Q3H6 259 aa14.68□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr741L7N1Y5 311 aa14.68□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gp5O08742 567 aa14.68□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 HgdO09173 445 aa14.68□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Npc1O35604 1277 aa14.68□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Neu1O35657 409 aa14.68□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 HbaP01942 142 aa14.68□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mtnd2P03893 345 aa14.68□□□□□ -0.06
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cd3gP11942 182 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.7 ms