Protein–RNA interactions for Protein: P14211

Calr, Calreticulin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalrP14211 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CalrP14211 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CalrP14211 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CalrP14211 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CalrP14211 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CalrP14211 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CalrP14211 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CalrP14211 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CalrP14211 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CalrP14211 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CalrP14211 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CalrP14211 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CalrP14211 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CalrP14211 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CalrP14211 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CalrP14211 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CalrP14211 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CalrP14211 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CalrP14211 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CalrP14211 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CalrP14211 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CalrP14211 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CalrP14211 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CalrP14211 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CalrP14211 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CalrP14211 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CalrP14211 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CalrP14211 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CalrP14211 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CalrP14211 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CalrP14211 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CalrP14211 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CalrP14211 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CalrP14211 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CalrP14211 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CalrP14211 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CalrP14211 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CalrP14211 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CalrP14211 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CalrP14211 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CalrP14211 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CalrP14211 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CalrP14211 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CalrP14211 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CalrP14211 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CalrP14211 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CalrP14211 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CalrP14211 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CalrP14211 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CalrP14211 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CalrP14211 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CalrP14211 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CalrP14211 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CalrP14211 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CalrP14211 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CalrP14211 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CalrP14211 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CalrP14211 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CalrP14211 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CalrP14211 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CalrP14211 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CalrP14211 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CalrP14211 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CalrP14211 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CalrP14211 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CalrP14211 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CalrP14211 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CalrP14211 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CalrP14211 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CalrP14211 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CalrP14211 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CalrP14211 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CalrP14211 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CalrP14211 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CalrP14211 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CalrP14211 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CalrP14211 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CalrP14211 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CalrP14211 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CalrP14211 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CalrP14211 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CalrP14211 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CalrP14211 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CalrP14211 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CalrP14211 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CalrP14211 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CalrP14211 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CalrP14211 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CalrP14211 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CalrP14211 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CalrP14211 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CalrP14211 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CalrP14211 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CalrP14211 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CalrP14211 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CalrP14211 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CalrP14211 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CalrP14211 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CalrP14211 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CalrP14211 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms