RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	COPS4	Q9BT78	406 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	NIN	Q8N4C6	2090 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PRAMEF10	O60809	474 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJB5	O75953	348 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PAPLN	O95428	1278 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	MYOG	P15173	224 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PSMB5	P28074	263 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ACADL	P28330	430 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC103	Q8IW40	242 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	METTL4	Q8N3J2	472 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	OR2L2	Q8NH16	312 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	BAD	Q92934	168 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	FAM129B	Q96TA1	746 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	EHD1	Q9H4M9	534 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PCDH17	O14917	1159 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PCCB	P05166	539 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CD36	P16671	472 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PERM1	Q5SV97	790 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SVOP	Q8N4V2	548 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	F2RL3	Q96RI0	385 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	LGR4	Q9BXB1	951 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0G2JN53	185 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	FAM227A	F5H4B4	570 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PI15	O43692	258 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ACVR2A	P27037	513 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CCR3	P51677	355 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PDE7A	Q13946	482 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	DUSP7	Q16829	419 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ADCK1	Q86TW2	530 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PLD3	Q8IV08	490 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	OXR1	Q8N573	874 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	YIPF6	Q96EC8	236 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	WDR34	Q96EX3	536 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PITX2	Q99697	317 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	MYNN	Q9NPC7	610 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN25	C9JDP6	229 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152		H7BY64	318 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SLC22A1	O15245	554 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SH3BP5	O60239	455 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	EPHX1	P07099	455 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	WAS	P42768	502 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CNTN1	Q12860	1018 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	RGS21	Q2M5E4	152 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	AMZ2	Q86W34	360 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF347	Q96SE7	839 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	GPR83	Q9NYM4	423 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PLPP1	O14494	284 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	LAT	O43561	262 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SERPIND1	P05546	499 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF12	P17014	697 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	LIPA	P38571	399 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SLC19A1	P41440	591 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	HSPB3	Q12988	150 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	MICA	Q29983	383 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SZRD1	Q7Z422	152 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	RAB8B	Q92930	207 aa		12.5	□□□□□ -0.41

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