RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 RHOJQ9H4E5 214 aa17.98■□□□□ 0.47
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SH3BP2-220ENST00000511663 WWOXQ9NZC7 414 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 SAR1BQ9Y6B6 198 aa17.98■□□□□ 0.47
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SH3BP2-220ENST00000511663 USP27XA6NNY8 438 aa17.97■□□□□ 0.47
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SH3BP2-220ENST00000511663 SNX31Q8N9S9 440 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 C16orf52Q8NHV5 167 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM57AQ8TBR7 257 aa17.96■□□□□ 0.47
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SH3BP2-220ENST00000511663 CHTF18Q8WVB6 975 aa17.96■□□□□ 0.47
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SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-220ENST00000511663 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-220ENST00000511663 CLNKQ7Z7G1 428 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA6LQ8N4H0 392 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-220ENST00000511663 C7orf57Q8NEG2 295 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA1191Q96A73 305 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-220ENST00000511663 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-220ENST00000511663 DMRTA2Q96SC8 542 aa17.94■□□□□ 0.46
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