RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP2K4P45985 399 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 MAPK7Q13164 816 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 APOFQ13790 326 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC14Q15048 493 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 CARTPTQ16568 116 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF699Q32M78 642 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 AKIRIN2Q53H80 203 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 FSTL4Q6MZW2 842 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 DCUN1D2Q6PH85 259 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF720Q7Z2F6 126 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF438Q7Z4V0 828 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 PDSS2Q86YH6 399 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 ENTHD1Q8IYW4 607 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 DAW1Q8N136 415 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 AHI1Q8N157 1196 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 OR5D18Q8NGL1 313 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 MYLPFQ96A32 169 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 S100PBPQ96BU1 408 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPAN17Q96FV3 270 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 MED18Q9BUE0 208 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 SH3BP4Q9P0V3 963 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 WASF3Q9UPY6 502 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 AUP1Q9Y679 476 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 CENPFP49454 3210 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 C9orf170A2RU37 121 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 ISPDA4D126 451 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 SHISA7A6NL88 538 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 K7ESF4 209 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 LEFTY2O00292 366 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 RHBDL1O75783 438 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 SERPINA3P01011 423 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 F11P03951 625 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 MMP2P08253 660 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 ARSAP15289 507 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 RHOQP17081 205 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP2F1P24903 491 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 NTSR1P30989 418 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 CCR7P32248 378 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 ST8SIA6P61647 398 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 BNC1Q01954 994 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 TNK2Q07912 1038 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 DNASE1L3Q13609 305 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 TFDP2Q14188 446 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 DLG2Q15700 870 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 KYNUQ16719 465 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 ACSBG2Q5FVE4 666 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM26FQ5R3K3 315 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 TFAP2EQ6VUC0 442 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 GPAT4Q86UL3 456 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 DDIASQ8IXT1 998 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 OR6Y1Q8NGX8 325 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf216Q8TAB5 229 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 SMARCD1Q96GM5 515 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF597Q96LX8 424 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 KLHL15Q96M94 604 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 INTS14Q96SY0 518 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 TOLLIPQ9H0E2 274 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 MAGEH1Q9H213 219 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 SMPD4Q9NXE4 827 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 GUCA1BQ9UMX6 200 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 KLHL20Q9Y2M5 609 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC00862A6NCI5 91 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 GSTA4O15217 222 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMD3O43242 534 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 SPINT1O43278 529 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 SPAG7O75391 227 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 MOCS3O95396 460 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 CHRNGP07510 517 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 PEPDP12955 493 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 BRAFP15056 766 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 CTSSP25774 331 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPN4P29074 926 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 CAPGP40121 348 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 CAPZBP47756 277 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 PRPS1P60891 318 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 NOMO3P69849 1222 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC7A9P82251 487 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 TGM3Q08188 693 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 MERTKQ12866 999 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 ASAH1Q13510 395 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 NOMO1Q15155 1222 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFP69Q49AA0 526 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 Q5BKY6 102 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-213ENST00000496055 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.1 ms