RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 ADAM15Q13444 863 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00471Q8N535 108 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PTTG2Q9NZH5 202 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 J3QRK9 145 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 TBX10O75333 385 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ASPGQ86U10 573 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 OR2L2Q8NH16 312 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 SHKBP1Q8TBC3 707 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 FTSJ1Q9UET6 329 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ACSL5Q9ULC5 683 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PEAK1Q9H792 1746 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 METTL21EPA6NDL7 271 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 NADK2Q4G0N4 442 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 IL17FQ96PD4 163 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 GNG2P59768 71 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 KCNC3Q14003 757 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 GALNT11Q8NCW6 608 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 WACQ9BTA9 647 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ACTR3BQ9P1U1 418 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 LSM1O15116 133 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 IL3P08700 152 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 NR2C1P13056 603 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 FPR1P21462 350 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEA12P43365 314 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 FBXL3Q9UKT7 428 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 OR6C70A6NIJ9 312 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 NPIPA2E9PIF3 369 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 NPIPA3F8WFD2 350 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 SGCAQ16586 387 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 IGLON5A6NGN9 336 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PFKLP17858 780 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 RPL26P61254 145 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 NKAPLQ5M9Q1 402 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 REEP3Q6NUK4 255 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 FAM86B1Q8N7N1 296 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 RBP7Q96R05 134 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 MS4A12Q9NXJ0 267 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 HEPACAM2A8MVW5 462 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 NUAK1O60285 661 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 SLAMF1Q13291 335 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 OSTF1Q92882 214 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC9A3P48764 834 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM107Q6UX40 140 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 SCGB3A2Q96PL1 93 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PCYT2Q99447 389 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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PTPRM-201ENST00000332175 ENY2Q9NPA8 101 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PROM1O43490 865 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRM-201ENST00000332175 ABHD18Q0P651 414 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf189Q5VU69 101 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 TM9SF3Q9HD45 589 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRM-201ENST00000332175 FAM227AF5H4B4 570 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 XPNPEP2O43895 674 aa21.54■■□□□ 1.04
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PTPRM-201ENST00000332175 GSKIPQ9P0R6 139 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 WASF3Q9UPY6 502 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ALG10Q5BKT4 473 aa21.54■■□□□ 1.04
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PTPRM-201ENST00000332175 NSMAFQ92636 917 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 GLYATL1Q969I3 302 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 WDR92Q96MX6 357 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 BEX2Q9BXY8 128 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 DPAGT1Q9H3H5 408 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 BEX1Q9HBH7 125 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 CMAHPQ9Y471 501 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ATF6P18850 670 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 CD9P21926 228 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 TRAM2Q15035 370 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
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PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PQU0 124 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ARL6IP5O75915 188 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 LHCGRP22888 699 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 MSX1P28360 303 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PGGT1BP53609 377 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ANKDD1AQ495B1 522 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 NUP43Q8NFH3 380 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 OR51G2Q8NGK0 314 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 TRIB2Q92519 343 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 KCNJ9Q92806 393 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf74Q96LT6 269 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 OR1F2PQ96R84 312 aa21.54■■□□□ 1.04
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