RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000176216.8

Cux1-207, Transcript of Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cux1, Length 2,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1-207ENSMUST00000176216 Nectin3Q9JLB9 549 aa9.97□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Socs6Q9JLY0 533 aa9.97□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 PrepQ9QUR6 710 aa9.97□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Zfp383A0A087WRR7 490 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 AccsA2AIG8 502 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Iqca1lA6H690 825 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Zcchc7B1AX39 541 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 RerglB2RVE2 204 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Gm7945F6QI24 236 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Zfp871G5E905 615 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 1700014D04RikJ3QMS2 983 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Hmox2O70252 315 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Cldn2O88552 230 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Fabp3P11404 133 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Hoxd8P23463 289 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 ThP24529 498 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Klkb1P26262 638 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Rps13P62301 151 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Adra1bP97717 514 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Apoa1Q00623 264 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 B4galnt2Q09199 510 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Fam47cQ14BE7 430 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Tgtp2Q3T9E4 415 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Nutm2Q3V0C3 733 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Tgtp1Q62293 415 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Sqstm1Q64337 442 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Cyp1b1Q64429 543 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Zc3h11aQ6NZF1 792 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Galnt7Q80VA0 657 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Q8BGK9 164 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Atl1Q8BH66 558 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Tbl3Q8C4J7 801 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Ccdc142Q8CAI1 738 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Kctd2Q8CEZ0 266 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Ift80Q8K057 777 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Vmn1r69Q8VIC1 319 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Q91V76 315 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 Ranbp3Q9CT10 491 aa9.96□□□□□ -0.81
Cux1-207ENSMUST00000176216 BC034090A0A087WP46 1202 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Skint7A7XV04 395 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Socs5O54928 536 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Pax7P47239 503 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Nat3P50296 290 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Stard6P59096 233 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Fam105aQ3TVP5 353 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Gm5460Q3UQ97 254 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Tex10Q3URQ0 928 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Med22Q62276 200 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Krr1Q8BGA5 380 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Slc41a2Q8BYR8 573 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 ZwilchQ8R060 589 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Olfr986Q8VFN6 312 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Olfr818Q8VG46 318 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Camk1Q91YS8 374 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Mau2Q9D2X5 619 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 PlgrktQ9D3P8 147 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Fam122aQ9DB52 284 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Atp6ap1Q9R1Q9 463 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Ehd1Q9WVK4 534 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Skp2Q9Z0Z3 424 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Fkbp9Q9Z247 570 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Rgs6Q9Z2H2 472 aa9.96□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Esp18A8R0V1 91 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Olfr521E9Q519 321 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 AF366264G3X9P9 502 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Serpinb9eO08806 377 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Kpna3O35344 521 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Sult3a1O35403 293 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 CkmP07310 381 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 JundP15066 341 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 EnpepP16406 945 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Rph3aP47708 681 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Gpr165Q3V3A3 455 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Tmem199Q5SYH2 208 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Olfr1307Q7TQX1 312 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 ZfatQ7TS63 1237 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Enkd1Q7TSV9 346 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Lrrtm3Q8BZ81 582 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 ScaiQ8C8N2 606 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Ddx52Q8K301 598 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Fndc5Q8K4Z2 209 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Dlg2Q91XM9 852 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Desi1Q9CQT7 168 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Arpc5lQ9D898 153 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Acsl4Q9QUJ7 711 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Olfr71Q9QZ18 312 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Chd3B1AR17 2055 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Ralgps1A2AR50 585 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Cldn34b1B1AZQ8 209 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 AU018091E9PWS4 684 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Gm5861F6VCN9 180 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 4933402N22RikF7D1B3 190 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Capns1O88456 269 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Mup4P11590 178 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Bmp7P23359 430 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Ppm1aP49443 382 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Ruvbl1P60122 456 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Rab8bP61028 207 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 PomkQ3TUA9 349 aa9.95□□□□□ -0.82
Cux1-207ENSMUST00000176216 Stox2Q499E5 926 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 75.3 ms