RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021278.13

Ctc1-201, Transcript of CST complex subunit CTC1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctc1, Length 4,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fam46aD3Z5S8 447 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Btbd16E9Q173 522 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr173E9QAT7 321 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm3542K7N6U2 270 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Psmc3ipO35047 217 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ptp4a2O70274 167 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kcnn4O89109 425 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 AldocP05063 363 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prkar2aP12367 401 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tbxas1P36423 533 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Adora2aQ60613 410 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ttf1Q62187 859 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Awat2Q6E1M8 333 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lix1Q6P566 282 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1308Q7TQX0 320 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tdp1Q8BJ37 609 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Riox2Q8CD15 465 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 PolbQ8K409 335 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Efcab7Q8VDY4 628 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr734Q8VFT4 313 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Syde1Q9DBZ9 737 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa8.96□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tmem236A2ARJ3 344 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm14085A2AWR5 660 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr603L7N1Y4 312 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 OsmrO70458 971 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 RrasP10833 218 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 NdnP25233 325 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Itgb7P26011 806 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sept4P28661 478 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 QrfprP83861 433 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kcnq1P97414 668 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q3UE31 404 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm11437Q5QR91 290 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CochQ62507 552 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1225Q7TR01 311 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr392Q7TRX6 312 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 ChdhQ8BJ64 596 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Yipf6Q8BR70 236 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rell2Q8BRJ3 303 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ero1bQ8R2E9 467 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1461Q8VEV7 312 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Klhl22Q99JN2 634 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Aloxe3Q9WV07 711 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Abhd12bG3UZN6 359 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prl6a1O35257 230 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mmp10O55123 476 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sox3P53784 375 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rab4aP56371 218 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 SgcgP82348 291 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hyal4Q05A56 481 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CblbQ3TTA7 982 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cdkl4Q3TZA2 342 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Crhr2Q60748 411 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Galnt2Q6PB93 570 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mindy2Q6PDI6 601 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Naaladl1Q7M758 745 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr487Q7TRU9 314 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rrnad1Q8BZG5 475 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc24a4Q8CGQ8 622 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ift80Q8K057 777 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc45a3Q8K0H7 553 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Casc3Q8K3W3 698 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp940Q8R2Q3 566 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Atxn7Q8R4I1 867 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1417Q8VGJ6 315 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr622Q8VGY7 317 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Stoml2Q99JB2 353 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ten1Q9D7K2 161 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q9DAD0 168 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ca7Q9ERQ8 264 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pkmyt1Q9ESG9 490 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Adat1Q9JHI2 499 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ak1Q9R0Y5 194 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Loxl3Q9Z175 754 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sbno2Q7TNB8 1349 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr634-ps1A0A1B0GRN7 318 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 4932443I19RikA0A286YE38 169 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1305A2AVW3 312 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cnih2O35089 160 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mboat4P0C7A3 435 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kcne1P23299 129 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Glb1P23780 647 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 GalP47212 124 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 St3gal1P54751 337 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ufm1P61961 85 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Spryd7Q3TFQ1 196 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Znf354aQ61751 572 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Bcl2l1Q64373 233 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q6GQV0 436 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rxfp3Q8BGE9 472 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q8C4X7 151 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 NaprtQ8CC86 538 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Celf3Q8CIN6 465 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 RbksQ8R1Q9 323 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ccm2lQ8VCC6 481 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Acer2Q8VD53 275 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sult5a1Q91X36 291 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tmem51Q99LG1 249 aa8.95□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Decr1Q9CQ62 335 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.9 ms