Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC6

Ccm2l, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2lQ8VCC6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccm2lQ8VCC6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccm2lQ8VCC6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccm2lQ8VCC6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccm2lQ8VCC6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccm2lQ8VCC6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccm2lQ8VCC6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccm2lQ8VCC6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccm2lQ8VCC6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccm2lQ8VCC6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccm2lQ8VCC6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccm2lQ8VCC6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccm2lQ8VCC6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccm2lQ8VCC6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccm2lQ8VCC6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccm2lQ8VCC6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccm2lQ8VCC6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccm2lQ8VCC6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccm2lQ8VCC6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccm2lQ8VCC6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccm2lQ8VCC6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccm2lQ8VCC6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccm2lQ8VCC6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccm2lQ8VCC6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccm2lQ8VCC6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccm2lQ8VCC6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccm2lQ8VCC6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccm2lQ8VCC6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccm2lQ8VCC6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccm2lQ8VCC6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccm2lQ8VCC6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccm2lQ8VCC6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccm2lQ8VCC6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccm2lQ8VCC6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccm2lQ8VCC6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccm2lQ8VCC6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccm2lQ8VCC6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccm2lQ8VCC6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccm2lQ8VCC6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccm2lQ8VCC6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccm2lQ8VCC6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccm2lQ8VCC6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccm2lQ8VCC6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccm2lQ8VCC6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccm2lQ8VCC6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccm2lQ8VCC6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccm2lQ8VCC6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccm2lQ8VCC6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccm2lQ8VCC6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccm2lQ8VCC6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccm2lQ8VCC6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccm2lQ8VCC6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccm2lQ8VCC6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccm2lQ8VCC6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccm2lQ8VCC6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccm2lQ8VCC6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccm2lQ8VCC6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccm2lQ8VCC6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccm2lQ8VCC6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccm2lQ8VCC6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccm2lQ8VCC6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccm2lQ8VCC6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccm2lQ8VCC6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccm2lQ8VCC6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccm2lQ8VCC6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccm2lQ8VCC6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccm2lQ8VCC6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccm2lQ8VCC6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccm2lQ8VCC6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccm2lQ8VCC6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccm2lQ8VCC6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccm2lQ8VCC6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccm2lQ8VCC6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccm2lQ8VCC6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccm2lQ8VCC6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccm2lQ8VCC6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccm2lQ8VCC6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccm2lQ8VCC6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccm2lQ8VCC6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccm2lQ8VCC6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccm2lQ8VCC6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccm2lQ8VCC6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccm2lQ8VCC6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccm2lQ8VCC6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccm2lQ8VCC6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccm2lQ8VCC6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccm2lQ8VCC6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccm2lQ8VCC6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccm2lQ8VCC6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccm2lQ8VCC6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccm2lQ8VCC6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccm2lQ8VCC6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccm2lQ8VCC6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccm2lQ8VCC6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccm2lQ8VCC6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccm2lQ8VCC6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccm2lQ8VCC6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccm2lQ8VCC6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccm2lQ8VCC6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccm2lQ8VCC6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms