Protein–RNA interactions for Protein: P10833

Rras, Ras-related protein R-Ras, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrasP10833 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RrasP10833 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RrasP10833 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RrasP10833 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RrasP10833 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RrasP10833 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RrasP10833 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RrasP10833 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RrasP10833 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RrasP10833 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RrasP10833 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RrasP10833 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RrasP10833 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RrasP10833 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RrasP10833 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RrasP10833 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RrasP10833 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RrasP10833 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RrasP10833 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RrasP10833 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RrasP10833 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RrasP10833 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RrasP10833 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RrasP10833 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RrasP10833 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RrasP10833 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RrasP10833 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RrasP10833 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RrasP10833 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RrasP10833 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RrasP10833 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RrasP10833 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RrasP10833 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RrasP10833 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RrasP10833 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RrasP10833 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RrasP10833 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RrasP10833 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RrasP10833 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RrasP10833 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RrasP10833 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RrasP10833 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RrasP10833 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RrasP10833 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RrasP10833 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RrasP10833 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RrasP10833 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RrasP10833 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RrasP10833 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RrasP10833 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RrasP10833 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RrasP10833 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RrasP10833 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RrasP10833 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RrasP10833 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RrasP10833 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RrasP10833 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RrasP10833 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RrasP10833 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RrasP10833 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RrasP10833 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RrasP10833 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RrasP10833 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RrasP10833 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RrasP10833 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RrasP10833 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RrasP10833 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RrasP10833 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RrasP10833 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RrasP10833 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RrasP10833 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RrasP10833 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RrasP10833 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RrasP10833 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RrasP10833 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RrasP10833 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RrasP10833 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RrasP10833 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RrasP10833 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RrasP10833 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RrasP10833 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RrasP10833 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RrasP10833 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RrasP10833 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RrasP10833 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RrasP10833 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RrasP10833 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RrasP10833 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RrasP10833 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RrasP10833 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RrasP10833 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RrasP10833 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RrasP10833 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RrasP10833 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RrasP10833 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RrasP10833 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RrasP10833 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RrasP10833 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RrasP10833 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RrasP10833 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms