RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 HERPUD2Q9BSE4 406 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 PCDHGA12O60330 932 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 AHSA1O95433 338 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 AK1P00568 194 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 EDN1P05305 212 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 ATP6AP1Q15904 470 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM26DQ5JW98 314 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 MEDAGQ5VYS4 303 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 ALKAL1Q6UXT8 129 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 ARMCX6Q7L4S7 300 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 ISCA2Q86U28 154 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 PROKR2Q8NFJ6 384 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 PNPLA2Q96AD5 504 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 KLHL42Q9P2K6 505 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 KLHL18O94889 574 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 FHP07954 510 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 C8orf89P0DMQ9 161 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 HOXC13P31276 330 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC7A9P82251 487 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 FBXO42Q6P3S6 717 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 QSOX2Q6ZRP7 698 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 TREML1Q86YW5 311 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 CHST4Q8NCG5 386 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 IL4I1Q96RQ9 567 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 ITPAQ9BY32 194 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC17A9Q9BYT1 436 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 PDE7BQ9NP56 450 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 KLRF1Q9NZS2 232 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 UGDHO60701 494 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 IL3P08700 152 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 GRB7Q14451 532 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 OR4D1Q15615 310 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 TP53INP2Q8IXH6 220 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF676Q8N7Q3 588 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 FOXJ1Q92949 421 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 XKR8Q9H6D3 395 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 PTGES2Q9H7Z7 377 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 TRIM36Q9NQ86 728 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 MBD2Q9UBB5 411 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 H0YAE9 185 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 FANCGO15287 622 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 HPRP00739 348 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 MXD1Q05195 221 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 PTGR1Q14914 329 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 SGCBQ16585 318 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 C3orf58Q8NDZ4 430 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 CAPSLQ8WWF8 208 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 MARK1Q9P0L2 795 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 PCTPQ9UKL6 214 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 PIAS3Q9Y6X2 628 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 MYH8P13535 1937 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 SOCS7O14512 581 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 TFECO14948 347 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 ADAMTS4O75173 837 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 ARL6IP5O75915 188 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC6A4P31645 630 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 RAB28P51157 221 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 OR52E8Q6IFG1 317 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF852Q6ZMS4 543 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 SORCS1Q8WY21 1168 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 ARNT2Q9HBZ2 717 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 TMEM184CQ9NVA4 438 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 CLEC4AQ9UMR7 237 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 A8MU76 341 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF879B4DU55 563 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 STATHP02808 62 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 RNH1P13489 461 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 ARSFP54793 590 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 TUBA1BP68363 451 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 TUBA3CQ13748 450 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 ABRAXAS2Q15018 415 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 COLEC12Q5KU26 742 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 TCEAL6Q6IPX3 200 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 MAST2Q6P0Q8 1798 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 TUBA1AQ71U36 451 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 SMPDL3BQ92485 455 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 MCHR1Q99705 422 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 DPH7Q9BTV6 452 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 DOHHQ9BU89 302 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 PELI2Q9HAT8 420 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 FABP12A6NFH5 140 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRVP-205ENST00000641549 DUX1O43812 170 aa12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms