RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 WDR54Q9H977 334 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLAMF7Q9NQ25 335 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CHRAC1Q9NRG0 131 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 TREX1Q9NSU2 369 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 TXLNGQ9NUQ3 528 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 P4HTMQ9NXG6 502 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 LUZP4Q9P127 313 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 PAK5Q9P286 719 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 KLHL20Q9Y2M5 609 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 KLK4Q9Y5K2 254 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
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TRAPPC8-202ENST00000577426 A0A1B0GX78 115 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 TARM1B6A8C7 271 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 AGPSO00116 658 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC8-202ENST00000577426 SOCS6O14544 535 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 DSCR3O14972 297 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 KPNA5O15131 536 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 PHF2O75151 1096 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ULK1O75385 1050 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 C1orf105O95561 183 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ALPPP05187 535 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 TUBBP07437 444 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC8-202ENST00000577426 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 MMP11P24347 488 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 NMBRP28336 390 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC8-202ENST00000577426 NPY2RP49146 381 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC8-202ENST00000577426 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC8-202ENST00000577426 PHC1P78364 1004 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC8-202ENST00000577426 CYP2A13Q16696 494 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 TYSND1Q2T9J0 566 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CCSMST1Q4G0I0 132 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC8-202ENST00000577426 KANK2Q63ZY3 851 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC8-202ENST00000577426 C8orf74Q6P047 294 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC8-202ENST00000577426 C4orf22Q6V702 233 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 Q6ZS92 163 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC8-202ENST00000577426 RNF44Q7L0R7 432 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 LRRC6Q86X45 466 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC8-202ENST00000577426 OR2A1Q8NGT9 310 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CFAP61Q8NHU2 1237 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 HMGCLL1Q8TB92 370 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 MAIP1Q8WWC4 291 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC8-202ENST00000577426 ZUFSPQ96AP4 578 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 RAD51AP1Q96B01 352 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 C19orf60Q96EN9 201 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC8-202ENST00000577426 KIFC1Q9BW19 673 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 IL22Q9GZX6 179 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 IRAK4Q9NWZ3 460 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CIDEBQ9UHD4 219 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 GNPTGQ9UJJ9 305 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ANAPC5Q9UJX4 755 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 FBXL4Q9UKA2 621 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 RAB21Q9UL25 225 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
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