RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.48□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM149AA5PLN7 773 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRRT4C9JH25 899 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 E9PQ18 207 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 H3BSA7 217 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SYT5O00445 386 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PDPK1O15530 556 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GPR39O43194 453 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RGS10O43665 173 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SH3BP5O60239 455 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CBFA2T3O75081 653 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF682O95780 498 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ADAP00813 363 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DNTTP04053 509 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IFNW1P05000 195 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EPHX1P07099 455 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LAMP1P11279 417 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CD22P20273 847 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DRD1P21728 446 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TACR1P25103 407 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HTR1BP28222 390 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CMPK1P30085 196 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NTSP30990 170 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SHMT2P34897 504 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MPIP34949 423 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GJA4P35212 333 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CA5AP35218 305 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 UGT2B10P36537 528 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CRATP43155 626 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MAPK12P53778 367 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KIAA1024LP59773 190 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRR5P85299 388 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TP53BP2Q13625 1128 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CAMK1Q14012 370 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SCARB2Q14108 478 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SELPLGQ14242 412 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RAB39AQ14964 217 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PTPRRQ15256 657 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CST6Q15828 149 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DGUOKQ16854 277 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MICAQ29983 383 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ADPRMQ3LIE5 342 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 COLEC12Q5KU26 742 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ENPP6Q6UWR7 440 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PTOV1Q86YD1 416 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SPARTQ8N0X7 666 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BBS10Q8TAM1 723 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PROX1Q92786 737 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KCNC2Q96PR1 638 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GABRG3Q99928 467 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MS4A8Q9BY19 250 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HMG20AQ9NP66 347 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EXD2Q9NVH0 621 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.47□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms