RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484581.6

VPS13A-211, Transcript of vacuolar protein sorting 13 homolog A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A, Length 1,155 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-211ENST00000484581 GPR50Q13585 617 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 SNX1Q13596 522 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 TRIM29Q14134 588 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 PDIA5Q14554 519 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 CARTPTQ16568 116 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 CT45A2Q5DJT8 189 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 XKR6Q5GH73 641 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 DHRS11Q6UWP2 260 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF852Q6ZMS4 543 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ANO5Q75V66 913 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 TMEM110Q86TL2 294 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 IQCF1Q8N6M8 205 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 GANCQ8TET4 914 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 SECTM1Q8WVN6 248 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 THRSPQ92748 146 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 GPR137Q96N19 417 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 UBAC1Q9BSL1 405 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 RIBC2Q9H4K1 309 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 MARCH7Q9H992 704 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ECHDC1Q9NTX5 307 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 FLRT3Q9NZU0 649 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 COPS7AQ9UBW8 275 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 IL20RAQ9UHF4 553 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 FBXL4Q9UKA2 621 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 RABL2BQ9UNT1 228 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa4.06□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 TMEM89A2RUT3 159 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 MTMR11A4FU01 709 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 CHEK1O14757 476 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 FPGTO14772 594 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 OGTO15294 1046 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 CHADO15335 359 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 GRID2O43424 1007 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 KIF5CO60282 957 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 GLRA3O75311 464 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 IDH1O75874 414 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 GSTA2P09210 222 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 CEACAM1P13688 526 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 B4GALT1P15291 398 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ITGA3P26006 1051 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 IFNAR2P48551 515 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 DNA2P51530 1060 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 MTTPP55157 894 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 HERV-K104P63124 156 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 GABPAQ06546 454 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 GPR17Q13304 367 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 RAPSNQ13702 412 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ITGA9Q13797 1035 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 SPHARQ15513 63 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 SLC27A4Q6P1M0 643 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 SLC24A5Q71RS6 500 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ZER1Q7Z7L7 766 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ISCA2Q86U28 154 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF573Q86YE8 665 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 OR7A2PQ8NGA2 310 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 OR52B4Q8NGK2 314 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 SELENOMQ8WWX9 145 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF583Q96ND8 569 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 TSPAN18Q96SJ8 248 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 S1PR3Q99500 378 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 PIGQQ9BRB3 760 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 RHNO1Q9BSD3 238 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 EGLN1Q9GZT9 426 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 GANQ9H2C0 597 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 VIPAS39Q9H9C1 493 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 TBC1D13Q9NVG8 400 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 RNF186Q9NXI6 227 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 TMOD2Q9NZR1 351 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 PILRAQ9UKJ1 303 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 GRID1Q9ULK0 1009 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ENTPD4Q9Y227 616 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ETV7Q9Y603 341 aa4.05□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 DISP3Q9P2K9 1392 aa4.04□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 UMODL1Q5DID0 1318 aa4.04□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa4.04□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 CLRN2A0PK11 232 aa4.04□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF732B4DXR9 585 aa4.04□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 MCF2LO15068 1137 aa4.04□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 CDK2AP2O75956 126 aa4.04□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 SYNGR4O95473 234 aa4.04□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 CPNE6O95741 557 aa4.04□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 EPOP01588 193 aa4.04□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 PROS1P07225 676 aa4.04□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 T-ENOLP0DO92 83 aa4.04□□□□□ -1.76
VPS13A-211ENST00000484581 GJB2P29033 226 aa4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms