RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EXT1Q16394 746 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HAS2Q92819 552 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PAFAH2Q99487 392 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LPAR4Q99677 370 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OPTCQ9UBM4 332 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SCN2AQ99250 2005 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HECTD1Q9ULT8 2610 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC189A1A4V9 331 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A8MUI8 341 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRMT3O60678 531 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLHL2O95198 593 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WDPCPO95876 746 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAOAP21397 527 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CASP2P42575 452 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TNFSF10P50591 281 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLA2G16P53816 162 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF33BQ06732 778 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RUNX2Q13950 521 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 E2F2Q14209 437 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SETDB1Q15047 1291 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACAP2Q15057 778 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NR6A1Q15406 480 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PFKFB4Q16877 469 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FCRLBQ6BAA4 426 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR2L5Q8NG80 312 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 M1APQ8TC57 530 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 QRFPRQ96P65 431 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR78Q96P69 363 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VPS11Q9H270 941 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNK13Q9HB14 408 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MMP25Q9NPA2 562 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NFU1Q9UMS0 254 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRRK2Q5S007 2527 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A088AWK7 358 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 B3GALT2O43825 422 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GFAPP14136 432 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EPB42P16452 691 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CERS1P27544 350 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MSH2P43246 934 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAGEA12P43365 314 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC26A5P58743 744 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FHL5Q5TD97 284 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLC3Q6P597 504 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYP4X1Q8N118 509 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TEX9Q8N6V9 391 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ISL2Q96A47 359 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 F2RL3Q96RI0 385 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RNF32Q9H0A6 362 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STMN3Q9NZ72 180 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRRC14BA6NHZ5 514 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLK8O60259 260 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CBX6O95503 412 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCNAP12004 261 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SERPINB9P50453 376 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAB38P57729 211 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCDH1Q08174 1060 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACER2Q5QJU3 275 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MED27Q6P2C8 311 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IFT20Q8IY31 132 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LAS2Q8IYD9 372 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms