RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393822.7

SFTPB-201, Transcript of surfactant protein B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPB, Length 3,666 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPB-201ENST00000393822 NPIPA7E9PJI5 369 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 NPIPA8P0DM63 369 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 DRD1P21728 446 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 SP140Q13342 867 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 GAB1Q13480 694 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 LIPJQ5W064 366 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 RRM2BQ7LG56 351 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 C16orf78Q8WTQ4 265 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 SLC29A3Q9BZD2 475 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 OR52A5Q9H2C5 316 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 EBF1Q9UH73 591 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 IL20RAQ9UHF4 553 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 MAGEA13PA6NCF6 341 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 G3V2T6 193 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 YY2O15391 372 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 SOX14O95416 240 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 HSMCR30P0CW71 290 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 CSRP3P50461 194 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 CLDN8P56748 225 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 TDGQ13569 410 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 LTB4RQ15722 352 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 PYCR3Q53H96 274 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 AAGABQ6PD74 315 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 SMOC1Q9H4F8 434 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 ATAD3AQ9NVI7 634 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 ST14Q9Y5Y6 855 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 CCDC88CQ9P219 2028 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 ACOT8O14734 319 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 SUV39H1O43463 412 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 OR10H2O60403 315 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 MATN4O95460 622 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 FAM58BPP0C7Q3 252 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 OR12D1P0DN82 309 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 CPN2P22792 545 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 CXCR2P25025 360 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 SLC7A1P30825 629 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 AVPR1BP47901 424 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 SLC6A12P48065 614 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 SLC16A1P53985 500 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 HPCAP84074 193 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 KCNAB1Q14722 419 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 SLC5A12Q1EHB4 618 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 C1orf189Q5VU69 101 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 TMEM26Q6ZUK4 368 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 ANKRD53Q8N9V6 530 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 OR5K2Q8NHB8 316 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 NECTIN4Q96NY8 510 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 GIMAP4Q9NUV9 329 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 ACTR3BQ9P1U1 418 aa10□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 C7orf72A4D263 438 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 PGRMC2O15173 223 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 TNFP01375 233 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 CCNA2P20248 432 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 NUDT6P53370 316 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 DCDC1P59894 354 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 BNIP2Q12982 314 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 SLC13A2Q13183 592 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 DUOXA1Q1HG43 343 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 METRNLQ641Q3 311 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 EID3Q8N140 333 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 SLC37A2Q8TED4 501 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 HDAC8Q9BY41 377 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 J3KTA2 159 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 PSMD11O00231 422 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 PLPP1O14494 284 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 PDPK1O15530 556 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 KLK8O60259 260 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 APOL3O95236 402 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 SLC35G6P0C7Q6 338 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 C21orf59P57076 290 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 GPR68Q15743 365 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 ALG11Q2TAA5 492 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 CCNJQ5T5M9 372 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 OGFOD2Q6N063 350 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 DLEU7Q6UYE1 221 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 PRSS41Q7RTY9 318 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 PAGE2Q7Z2X7 111 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 NLGN4XQ8N0W4 816 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 AVL9Q8NBF6 648 aa9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SFTPB-201ENST00000393822 BMFQ96LC9 184 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms