RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa19.85■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 FSHRP23945 695 aa19.85■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 DRD3P35462 400 aa19.85■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 MASP1P48740 699 aa19.85■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 NPRL3Q12980 569 aa19.85■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC5A12Q1EHB4 618 aa19.85■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa19.85■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 OR4C15Q8NGM1 316 aa19.85■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 OR5AK3PQ8NH89 298 aa19.85■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 LGR4Q9BXB1 951 aa19.85■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 TM7SF3Q9NS93 570 aa19.85■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 DOCK9Q9BZ29 2069 aa19.85■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 PCCBP05166 539 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 TAS2R38P59533 333 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 DSG4Q86SJ6 1040 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF130Q86XS8 419 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 CROCCP3Q8IVE0 287 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 KRT78Q8N1N4 520 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 SPPL2AQ8TCT8 520 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 CHFRQ96EP1 664 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 ACAT2Q9BWD1 397 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC6A16Q9GZN6 736 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC90BQ9GZT6 254 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 RHBGQ9H310 441 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 SPASTQ9UBP0 616 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 ICKQ9UPZ9 632 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 C5orf42Q9H799 3197 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 PLPP1O14494 284 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 NDUFS2O75306 463 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 WBP4O75554 376 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 EPHX1P07099 455 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 ARAFP10398 606 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 KRT20P35900 424 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 MLLT10P55197 1068 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 SPCS2Q15005 226 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 PDGFRLQ15198 375 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 IFI44LQ53G44 452 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 LRRTM4Q86VH4 590 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD53Q8N9V6 530 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 OR5K2Q8NHB8 316 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 APH1BQ8WW43 257 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 SIGLEC11Q96RL6 698 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 PELI2Q9HAT8 420 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 THSD1Q9NS62 852 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 TAC3Q9UHF0 121 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 TPRKBQ9Y3C4 175 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 TESMINQ9Y4I5 508 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 CKAP5Q14008 2032 aa19.84■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 NUMA1Q14980 2115 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1W2PRB8 838 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 TBC1D3BA6NDS4 549 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 ADAMDEC1O15204 470 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 SEMA3DO95025 777 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 BCL10O95999 233 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 RXRGP48443 463 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 RPP38P78345 283 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGAP19Q14CB8 494 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 NPTX1Q15818 432 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 CTF1Q16619 201 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 CYP2A13Q16696 494 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 WSCD2Q2TBF2 565 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 HRASLS5Q96KN8 279 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 MS4A8Q9BY19 250 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 RUBCNLQ9H714 662 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 TRPV4Q9HBA0 871 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 WASH6PQ9NQA3 447 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 OBP2AQ9NY56 170 aa19.83■□□□□ 0.77
KCNQ1-202ENST00000335475 IGLON5A6NGN9 336 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 PCDHGA12O60330 932 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 MT-ND2P03891 347 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 PXNP49023 591 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 CDK6Q00534 326 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 CRB2Q5IJ48 1285 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 AGBL4Q5VU57 503 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 METRNLQ641Q3 311 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM40Q6P9F5 258 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 C17orf64Q86WR6 236 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 ENTHD1Q8IYW4 607 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 FNDC8Q8TC99 324 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 UBE2FQ969M7 185 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 HSPBAP1Q96EW2 488 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 PREBQ9HCU5 417 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa19.83■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.2 ms