RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 PIGVQ9NUD9 493 aa10.21□□□□□ -0.77
CLN8-201ENST00000331222 HAO2Q9NYQ3 351 aa10.21□□□□□ -0.77
CLN8-201ENST00000331222 DPPA5A6NC42 116 aa10.21□□□□□ -0.77
CLN8-201ENST00000331222 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
CLN8-201ENST00000331222 PAX3P23760 479 aa10.21□□□□□ -0.77
CLN8-201ENST00000331222 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
CLN8-201ENST00000331222 DEFB110Q30KQ9 67 aa10.21□□□□□ -0.77
CLN8-201ENST00000331222 CFAP77Q6ZQR2 320 aa10.21□□□□□ -0.77
CLN8-201ENST00000331222 HAPLN3Q96S86 360 aa10.21□□□□□ -0.77
CLN8-201ENST00000331222 PITX2Q99697 317 aa10.21□□□□□ -0.77
CLN8-201ENST00000331222 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
CLN8-201ENST00000331222 SMURF2Q9HAU4 748 aa10.21□□□□□ -0.77
CLN8-201ENST00000331222 KCNK13Q9HB14 408 aa10.21□□□□□ -0.77
CLN8-201ENST00000331222 IL20RAQ9UHF4 553 aa10.21□□□□□ -0.77
CLN8-201ENST00000331222 ZNF850A8MQ14 1090 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ARPC2O15144 300 aa10.21□□□□□ -0.78
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CLN8-201ENST00000331222 CD79AP11912 226 aa10.21□□□□□ -0.78
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CLN8-201ENST00000331222 FRG2Q64ET8 278 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 LIX1LQ8IVB5 337 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 CCDC107Q8WV48 283 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 MOCOSQ96EN8 888 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 PEX11GQ96HA9 241 aa10.21□□□□□ -0.78
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CLN8-201ENST00000331222 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 CA12O43570 354 aa10.21□□□□□ -0.78
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CLN8-201ENST00000331222 ADAM15Q13444 863 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 TAS1R3Q7RTX0 852 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 SVOPLQ8N434 492 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 CLEC4DQ8WXI8 215 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
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CLN8-201ENST00000331222 NLGN3Q9NZ94 848 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 GMEB1Q9Y692 573 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 TLL2Q9Y6L7 1015 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa10.21□□□□□ -0.78
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CLN8-201ENST00000331222 PGGT1BP53609 377 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 RPA4Q13156 261 aa10.21□□□□□ -0.78
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CLN8-201ENST00000331222 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
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CLN8-201ENST00000331222 SLITRK4Q8IW52 837 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 C7orf34Q96L11 122 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 TMEM209Q96SK2 561 aa10.21□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 GIMAP2Q9UG22 337 aa10.21□□□□□ -0.78
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CLN8-201ENST00000331222 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 PEPDP12955 493 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
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CLN8-201ENST00000331222 RAB30Q15771 203 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 AADACL4Q5VUY2 407 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ADGRD1Q6QNK2 874 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP10.2□□□□□ -0.78
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CLN8-201ENST00000331222 ZDHHC12Q96GR4 267 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 RAB26Q9ULW5 256 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 CNTN6Q9UQ52 1028 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 MYOM1P52179 1685 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 PRORSD1PA6NEY8 169 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 SAGE2PA6NJ88 616 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 ADAMTS3O15072 1205 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 TSHRP16473 764 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 EPHA1P21709 976 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 CTHP32929 405 aa10.2□□□□□ -0.78
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CLN8-201ENST00000331222 OR4D6Q8NGJ1 314 aa10.2□□□□□ -0.78
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CLN8-201ENST00000331222 PIP5K1AQ99755 562 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 CXorf21Q9HAI6 301 aa10.2□□□□□ -0.78
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CLN8-201ENST00000331222 CD8B2A6NJW9 211 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 PROM1O43490 865 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 LEFTY1O75610 366 aa10.2□□□□□ -0.78
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CLN8-201ENST00000331222 CD8BP10966 210 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 RAB4BP61018 213 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 MLC1Q15049 377 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 WDR45BQ5MNZ6 344 aa10.2□□□□□ -0.78
CLN8-201ENST00000331222 TPRG1LQ5T0D9 272 aa10.2□□□□□ -0.78
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