RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 A6NNC1 897 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 FHP07954 510 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 GLI4P10075 376 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 FDFT1P37268 417 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 GPR85P60893 370 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PPIAP62937 165 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SKP1P63208 163 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PLGLB1Q02325 96 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 HERC3Q15034 1050 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 KLHL38Q2WGJ6 581 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 FBXW10Q5XX13 1052 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 NIPAL1Q6NVV3 410 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PEX26Q7Z412 305 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PDSS2Q86YH6 399 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 OR5M9Q8NGP3 310 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SLC13A3Q8WWT9 602 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 TBC1D20Q96BZ9 403 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PTCHD1Q96NR3 888 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CAPS2Q9BXY5 557 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 RAB17Q9H0T7 212 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 NEUROD4Q9HD90 331 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CHRAC1Q9NRG0 131 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CRIM1Q9NZV1 1036 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 AMFRQ9UKV5 643 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 TFR2Q9UP52 801 aa11.18□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 A0A0G2JNJ9 132 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 FEZF1A0PJY2 475 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 GOLGA6L10A6NI86 522 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SAGE2PA6NJ88 616 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SYT5O00445 386 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ESR1P03372 595 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SLC35G6P0C7Q6 338 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 HOXC12P31275 282 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 FMO4P31512 558 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 UQCRC1P31930 480 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 STIP1P31948 543 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CLCN2P51788 898 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 GDF10P55107 478 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ACSBG2Q5FVE4 666 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PCID2Q5JVF3 399 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CTSL3PQ5NE16 218 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 MRNIPQ6NTE8 343 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 KIAA0408Q6ZU52 694 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 MDGA2Q7Z553 956 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ASPGQ86U10 573 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SLC22A16Q86VW1 577 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 LIX1LQ8IVB5 337 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 OTUD6BQ8N6M0 293 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 KCT2Q8NC54 265 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 TM4SF19Q96DZ7 209 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 BIRC8Q96P09 236 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SMC6Q96SB8 1091 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ETNK1Q9HBU6 452 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 B4GALT7Q9UBV7 327 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 Q9UFV3 132 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ERVK-11Q9UQG0 969 aa11.17□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 FAM166BA8MTA8 275 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ZBTB14O43829 449 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 B4GALT2O60909 372 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 WDR1O75083 606 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 NIPSNAP2O75323 286 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ITGA10O75578 1167 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ATE1O95260 518 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 GRK3P35626 688 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 GRIA1P42261 906 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SSR4P51571 173 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 TYSND1Q2T9J0 566 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 FLYWCH1Q4VC44 716 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 AGBL2Q5U5Z8 902 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SHEQ5VZ18 495 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 AADACL2Q6P093 401 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SLC26A11Q86WA9 606 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ARMC2Q8NEN0 867 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 FAM136AQ96C01 138 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 TCF12Q99081 682 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 DMRT3Q9NQL9 472 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 FBXW2Q9UKT8 454 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ACAD8Q9UKU7 415 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 FAM215AQ9Y5M1 114 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 STAB1Q9NY15 2570 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ZNF860A6NHJ4 632 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 A8MVJ9 347 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 E5RI56 91 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 EBAG9O00559 213 aa11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms