RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 SCARB2Q14108 478 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 LRRC26Q2I0M4 334 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 GGHQ92820 318 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TMEM203Q969S6 136 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 PRAP1Q96NZ9 151 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SCN3BQ9NY72 215 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MOSPD1Q9UJG1 213 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 OR1A2Q9Y585 309 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MUC3AQ02505 3323 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 C1orf226A1L170 272 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SEMA7AO75326 666 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 GASTP01350 101 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CXCL10P02778 98 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 BCHEP06276 602 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 VIPR1P32241 457 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MAGEA2P43356 314 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 DEF8Q6ZN54 512 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SHFQ7M4L6 423 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SERPINA11Q86U17 422 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 LACC1Q8IV20 430 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TAC3Q9UHF0 121 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 PIPSLA2A3N6 862 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 GRXCR1A8MXD5 290 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SPINT1O43278 529 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 AIREO43918 545 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ATG13O75143 517 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 POP7O75817 140 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MYO1DO94832 1006 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SLCO2B1O94956 709 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 C1orf105O95561 183 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SOD1P00441 154 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SDHBP21912 280 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TGFBR2P37173 567 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CTSKP43235 329 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 GPR1P46091 355 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SLC7A9P82251 487 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ST3GAL4Q11206 333 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MTAPQ13126 283 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TIGD6Q17RP2 521 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 AQP11Q8NBQ7 271 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MCFD2Q8NI22 146 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 FAM129BQ96TA1 746 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 DUSP21Q9H596 190 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CXorf36Q9H7Y0 433 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ZNF226Q9NYT6 803 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 IL36AQ9UHA7 158 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 KCNE2Q9Y6J6 123 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CATP04040 527 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 PCCBP05166 539 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 GSTM1P09488 218 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ITIH1P19827 911 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TTKP33981 857 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 GSTM4Q03013 218 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MFSD4AQ8N468 514 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 AADATQ8N5Z0 425 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 YIPF6Q96EC8 236 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 LYSMD1Q96S90 227 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 APOL4Q9BPW4 351 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ZBP1Q9H171 429 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SLC6A17Q9H1V8 727 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CTDSP2O14595 271 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 B4GALT2O60909 372 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 LILRB3O75022 631 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 C9P02748 559 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MAPK1P28482 360 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 RYKP34925 604 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 HNMTP50135 292 aa8.29□□□□□ -1.08
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