RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 SMURF1Q9HCE7 757 aa11.57□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 TAS2R10Q9NYW0 307 aa11.57□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 GRHPRQ9UBQ7 328 aa11.57□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa11.57□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 YIPF1Q9Y548 306 aa11.57□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 MAB21L2Q9Y586 359 aa11.57□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 LOC100509620A0A075B734 347 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 VAMP1P23763 118 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 ATG9BQ674R7 924 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 TPRG1Q6ZUI0 275 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 TSPEARQ8WU66 669 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 PLAGL1Q9UM63 463 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 PSAT1Q9Y617 370 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 CDH10Q9Y6N8 788 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 UPK3BL1B0FP48 263 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 UPK3BL2E5RIL1 263 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 SNAP29O95721 258 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 CSTBP04080 98 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 ALPPL2P10696 532 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 CD47Q08722 323 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 REEP3Q6NUK4 255 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 AGTRAPQ6RW13 159 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 PHOX2BQ99453 314 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 TMEM175Q9BSA9 504 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 KCNH6Q9H252 994 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 ALKBH4Q9NXW9 302 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 DFNA5O60443 496 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 PRAMEF11O60813 436 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 RP2O75695 350 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 GBAP04062 536 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 MAGEA8P43361 318 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 E2F1Q01094 437 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 TRAM2Q15035 370 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 UGT8Q16880 541 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 SPIN3Q5JUX0 258 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 KCTD9Q7L273 389 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 LNX2Q8N448 690 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 MARVELD2Q8N4S9 558 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 OR51B5Q9H339 312 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 A0A096LPI6 279 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 POP7O75817 140 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 C8orf89P0DMQ9 161 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 KCNQ1P51787 676 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 MLLT10P55197 1068 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 SPRYD7Q5W111 196 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 ORAI3Q9BRQ5 295 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 Q9N2J8 555 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 LAMP5Q9UJQ1 280 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 TMEM5Q9Y2B1 443 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 SERINC3Q13530 473 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 RHEBQ15382 184 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 TREML1Q86YW5 311 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 TICAM1Q8IUC6 712 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 GID4Q8IVV7 300 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 ZNF382Q96SR6 550 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 REEP4Q9H6H4 257 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 CAPN14A8MX76 684 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 E7EQ34 232 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 HCRTO43612 131 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 DNAJB5O75953 348 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 HTR1EP28566 365 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 OR1E2P47887 323 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 CDKL4Q5MAI5 379 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 C7orf57Q8NEG2 295 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 ZNF700Q9H0M5 742 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 SEC61A2Q9H9S3 476 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 PROM1O43490 865 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 HCKP08631 526 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 GNAO1P09471 354 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 C7P10643 843 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 SRCP12931 536 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 PROZP22891 400 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 ZNF763Q0D2J5 394 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 MOGSQ13724 837 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 TRAM1Q15629 374 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 ODF4Q2M2E3 257 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 Q6ZVU0 165 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 PSD4Q8NDX1 1056 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 OR9A1PQ8NGU1 263 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 NPY6RQ99463 290 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 RNF39Q9H2S5 420 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS1-220ENST00000611415 SDHAF3Q9NRP4 125 aa11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms