RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559491.1

RNF31-215, Transcript of ring finger protein 31, human

TSL 2

Gene RNF31, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF31-215	ENST00000559491	SERPIND1	P05546	499 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	HSD17B3	P37058	310 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	RGS4	P49798	205 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	AGTR2	P50052	363 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	HYAL2	Q12891	473 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	OR1C1	Q15619	314 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	NSDHL	Q15738	373 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	BBS9	Q3SYG4	887 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	PALM2	Q8IXS6	379 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	OR56A3	Q8NH54	315 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	M1AP	Q8TC57	530 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	NEIL2	Q969S2	332 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	CERS2	Q96G23	380 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	SCMH1	Q96GD3	660 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	KLHL31	Q9H511	634 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	MMP25	Q9NPA2	562 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	ARL15	Q9NXU5	204 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	TRBC2	A0A5B9	178 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	C19orf84	I3L1E1	186 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	RIPK2	O43353	540 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	SLC19A2	O60779	497 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	B4GALT2	O60909	372 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	SASH3	O75995	380 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	NEURL1	O76050	574 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	FH	P07954	510 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	CYC1	P08574	325 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	GSTA2	P09210	222 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	HNF4A	P41235	474 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	ELK3	P41970	407 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	MAGEA4	P43358	317 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	CCR8	P51685	355 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	OR4D2	P58180	307 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	SLC26A5	P58743	744 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	AP2B1	P63010	937 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	HSF1	Q00613	529 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	ART3	Q13508	389 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	ZNF460	Q14592	562 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	MEP1A	Q16819	746 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	SBSN	Q6UWP8	590 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	GPATCH11	Q8N954	259 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	FBXL8	Q96CD0	374 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	CFAP36	Q96G28	342 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	FRMD6	Q96NE9	622 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	LPAR4	Q99677	370 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	NAT9	Q9BTE0	207 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	SARG	Q9BW04	601 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	PSAT1	Q9Y617	370 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		10.77	□□□□□ -0.68
RNF31-215	ENST00000559491		A8MUA0	341 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	CDC7	O00311	574 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	ALOX12	P18054	663 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	HIST1H2AD	P20671	130 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	MAOA	P21397	527 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	CCND1	P24385	295 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	HTR1E	P28566	365 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	GRK3	P35626	688 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	SCTR	P47872	440 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	IL2	P60568	153 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	RAB8A	P61006	207 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	HERC3	Q15034	1050 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	EXT1	Q16394	746 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RNF31-215	ENST00000559491	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69

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