RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa15.61■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 IGF2RP11717 2491 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A088AWK7 358 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 SERTM1A2A2V5 107 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM114B3SHH9 223 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 MANBAO00462 879 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 DYNC1I1O14576 645 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ULK1O75385 1050 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 KLHL18O94889 574 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 TGFB1P01137 390 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 FGF4P08620 206 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 HSD3B1P14060 373 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 FBLP22087 321 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 HSD3B2P26439 372 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 RAB8AP61006 207 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 RPS15P62841 145 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 NCF4Q15080 339 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 DEFB134Q4QY38 66 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 TRIM40Q6P9F5 258 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 COX15Q7KZN9 410 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 PRSS41Q7RTY9 318 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 CUZD1Q86UP6 607 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 PDSS2Q86YH6 399 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 AMER3Q8N944 861 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 MGARPQ8TDB4 240 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 SELENOMQ8WWX9 145 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 FAR2Q96K12 515 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 KCNC2Q96PR1 638 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 SERPINI1Q99574 410 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 CENPKQ9BS16 269 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ROGDIQ9GZN7 287 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 BRF2Q9HAW0 419 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 MLXIPLQ9NP71 852 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 MAU2Q9Y6X3 613 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 FRYQ5TBA9 3013 aa15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 URB1O60287 2271 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 C4orf51C9J302 202 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 SGK494L7N484 410 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 CRCPO75575 148 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 RECKO95980 971 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 PDYNP01213 254 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 CHRNGP07510 517 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 UROSP10746 265 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 NEFHP12036 1026 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 LIFP15018 202 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 F8A1P23610 371 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 PTPN4P29074 926 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 TSFMP43897 325 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 PPP2R2AP63151 447 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 MLIPQ5VWP3 458 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 UBE3DQ7Z6J8 389 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 TRIM42Q8IWZ5 723 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 RNF175Q8N4F7 328 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 RGMAQ96B86 450 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC45A3Q96JT2 553 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 QRFPRQ96P65 431 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 TGIF2Q9GZN2 237 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 OR51B5Q9H339 312 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 WDR54Q9H977 334 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 PRDM7Q9NQW5 492 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 TIMM22Q9Y584 194 aa15.59■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 ACACBO00763 2458 aa15.58■□□□□ 0.09
PACSIN3-210ENST00000533686 VSTM2BA6NLU5 285 aa15.58■□□□□ 0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 AZIN1O14977 448 aa15.58■□□□□ 0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 SEMA3DO95025 777 aa15.58■□□□□ 0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 BGNP21810 368 aa15.58■□□□□ 0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 IL10P22301 178 aa15.58■□□□□ 0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 PLA2G16P53816 162 aa15.58■□□□□ 0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 UCNP55089 124 aa15.58■□□□□ 0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 FOXA1P55317 472 aa15.58■□□□□ 0.08
PACSIN3-210ENST00000533686 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms