RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493441.5

SMYD3-217, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene SMYD3, Length 823 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-217ENST00000493441 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 CCDC77Q9BR77 488 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 NTMT1Q9BV86 223 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 SPACA6W5XKT8 324 aa6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 CGNL1Q0VF96 1302 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 A0A0U1RQV5 110 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 TMEM89A2RUT3 159 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 C15orf62A8K5M9 175 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 H0YC42 278 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 ADAM12O43184 909 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 GRID2O43424 1007 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 ACSL4O60488 711 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 SURF6O75683 361 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 GPD1P21695 349 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 HLA-FP30511 346 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 MXI1P50539 228 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 TNFSF10P50591 281 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 FKBP1BP68106 108 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 FUT7Q11130 342 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 TUBA3CQ13748 450 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 TDHQ8IZJ6 230 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 GIMAP5Q96F15 307 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 CAPNS2Q96L46 248 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 GUCD1Q96NT3 240 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.84□□□□□ -1.31
SMYD3-217ENST00000493441 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 C5P01031 1676 aa6.84□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 C17orf105B2RV13 164 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 TMEM178BH3BS89 294 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 K7EQM0 130 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 CHRNGP07510 517 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 SFTPBP07988 381 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 SERPINF2P08697 491 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 INSRRP14616 1297 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 TNNI3P19429 210 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 CALB2P22676 271 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 HTR2AP28223 471 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 PTPN6P29350 595 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 SSTR1P30872 391 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 TNFRSF4P43489 277 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 TNFRSF17Q02223 184 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 KIF5AQ12840 1032 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 IFT88Q13099 833 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.322e-6■■□□□ 13.5
SMYD3-217ENST00000493441 ZMYND11Q15326 602 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 CARTPTQ16568 116 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 STX1AQ16623 288 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 USH1GQ495M9 461 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 CAVIN4Q5BKX8 364 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 SMIM5Q71RC9 77 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 MAP7D3Q8IWC1 876 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 RFT1Q96AA3 541 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 TCEANC2Q96MN5 208 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 ZNF607Q96SK3 696 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 PCYT2Q99447 389 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 NARFQ9UHQ1 456 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 RNF114Q9Y508 228 aa6.83□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 INSRP06213 1382 aa6.82□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.82□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.82□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 H0Y8G0 127 aa6.82□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 H3BMM5 538 aa6.82□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 ITM2AO43736 263 aa6.82□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 LDB3O75112 727 aa6.82□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 BAG3O95817 575 aa6.82□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 HMBSP08397 361 aa6.82□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 DGKAP23743 735 aa6.82□□□□□ -1.32
SMYD3-217ENST00000493441 ADRA1AP35348 466 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms