RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM89A2RUT3 159 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 A8MU76 341 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 O00370 1275 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 EPHB6O15197 1021 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 TEX28O15482 410 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCDH7O60245 1069 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 CYTIPO60759 359 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRP3O75074 770 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRDM1O75626 825 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDK2AP2O75956 126 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLPTM1O96005 669 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 AMBPP02760 352 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAF1P04049 648 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRSS1P07477 247 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 YES1P07947 543 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 HMBSP08397 361 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 CEACAM1P13688 526 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 ITGB6P18564 788 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 ITGA3P26006 1051 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 SFNP31947 248 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSPA1LP34931 641 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR3A2P47893 321 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLK1P49759 484 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 EVCP57679 992 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 HERV-K104P63124 156 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 PHEXP78562 749 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 MYL7Q01449 175 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 WASHC5Q12768 1159 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 ITGA9Q13797 1035 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 GIT2Q14161 759 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTPN14Q15678 1187 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC35E4Q6ICL7 350 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR6B2Q6IFH4 312 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRIM65Q6PJ69 517 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 USP43Q70EL4 1123 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q71RC1 249 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 G2E3Q7L622 706 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPC2Q8N158 579 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC43A2Q8N370 569 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRIM58Q8NG06 486 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 C11orf45Q8TAV5 145 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBTD2Q8WUN7 234 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC13A3Q8WWT9 602 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 SUSD6Q92537 303 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 HAS2Q92819 552 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 EPYCQ99645 322 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 LPAR4Q99677 370 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBAC1Q9BSL1 405 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 PANK2Q9BZ23 570 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNF186Q9NXI6 227 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 FLRT3Q9NZU0 649 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM181Q9P2C4 612 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRDM4Q9UKN5 801 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 EXOC7Q9UPT5 735 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 C2CD2Q9Y426 696 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRP12Q9Y561 859 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCN5AQ14524 2016 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARID2Q68CP9 1835 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM172BPA6NC97 362 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 LMO7DNF2Z398 122 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 G3V2L1 256 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 M0R296 226 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCO2O43819 266 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAGEC1O60732 1142 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP6V1G1O75348 118 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SEC22BO75396 215 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 B3GALNT1O75752 331 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAD51DO75771 328 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CAVIN2O95810 425 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 EDN1P05305 212 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CFC1BP0CG36 223 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CFC1P0CG37 223 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ETS1P14921 441 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 AREGP15514 252 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CYP11B1P15538 503 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHRNB4P30926 498 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC1A3P43003 542 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 GLIPR1P48060 266 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CNN1P51911 297 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 BACE1P56817 501 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 HUNKP57058 714 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 STARD6P59095 220 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 GNB1P62873 340 aa2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms