RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362830.1

RNU6-223P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 223, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-223P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-223P-201ENST00000362830 CHURC1Q8WUH1 139 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC13A3Q8WWT9 602 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 C2orf48Q96LS8 159 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 NECTIN4Q96NY8 510 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ECHDC1Q9NTX5 307 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 TMOD3Q9NYL9 352 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 MIS18AQ9NYP9 233 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 FLRT3Q9NZU0 649 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 PILRAQ9UKJ1 303 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 PRDM4Q9UKN5 801 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ITM2BQ9Y287 266 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 MACROD2A1Z1Q3 448 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 PCDH7O60245 1069 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZG16O60844 167 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 TRMUO75648 421 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 STAM2O75886 525 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 SEC24AO95486 1093 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 RAF1P04049 648 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 YES1P07947 543 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 KRT3P12035 628 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ETS1P14921 441 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ACP1P24666 158 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ITGA3P26006 1051 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 CETN2P41208 172 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 TNFSF10P50591 281 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ATP12AP54707 1039 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 SRP54P61011 504 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ERVK11-1P61568 191 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 GALK2Q01415 458 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 PMP22Q01453 160 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 TMEM132DQ14C87 1099 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 PTPN14Q15678 1187 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 MAPK11Q15759 364 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF74Q16587 644 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ARMCX4Q5H9R4 360 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ARHGAP17Q68EM7 881 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 MFSD7Q6UXD7 560 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 WDR88Q6ZMY6 472 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC24A5Q71RS6 500 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 G2E3Q7L622 706 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 GPC2Q8N158 579 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 THEM5Q8N1Q8 247 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 OR10V1Q8NGI7 309 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 OR4A16Q8NH70 328 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 EXOC6Q8TAG9 804 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 TM9SF4Q92544 642 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 SEPT8Q92599 483 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 HAS2Q92819 552 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC35C1Q96A29 364 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 AZIN2Q96A70 460 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ESAMQ96AP7 390 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 TMEM186Q96B77 213 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLCO4A1Q96BD0 722 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 TBC1D31Q96DN5 1066 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 C16orf58Q96GQ5 468 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 RUFY1Q96T51 708 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 BARHL1Q9BZE3 327 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 RNF121Q9H920 327 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 SCRT2Q9NQ03 307 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC52A3Q9NQ40 469 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 PANK4Q9NVE7 773 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 TBC1D13Q9NVG8 400 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 NDUFA13Q9P0J0 144 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 TRIM10Q9UDY6 481 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 FBXL4Q9UKA2 621 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 DNPEPQ9ULA0 475 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 KCNJ14Q9UNX9 436 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 SH3GLB1Q9Y371 365 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 CACNA1FO60840 1977 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 A0A0U1RRA0 63 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 A0A1W2PR80 420 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 CCDC162PA2VCL2 907 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ANHXE9PGG2 379 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 MAGEB2O15479 319 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 TEX28O15482 410 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 P2RX6O15547 441 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 ADAM12O43184 909 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 EXTL3O43909 919 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 LRCH4O75427 683 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 B3GALNT1O75752 331 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 CPNE6O95741 557 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-223P-201ENST00000362830 TGFAP01135 160 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms