RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 OR14I1A6ND48 311 aa16.04■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ODC1P11926 461 aa16.04■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 CELP19835 753 aa16.04■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 DRD5P21918 477 aa16.04■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 LOC730098B7Z3J9 87 aa16.04■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 HLA-DPB1P04440 258 aa16.04■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 GNA13Q14344 377 aa16.04■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 TMEM132BQ14DG7 1078 aa16.04■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 HSDL2Q6YN16 418 aa16.04■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 SLC22A8Q8TCC7 542 aa16.04■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 DUSP26Q9BV47 211 aa16.04■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 OR51J1Q9H342 316 aa16.04■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 SLC23A1Q9UHI7 598 aa16.04■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 H3BRB1 525 aa16.03■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 ENTHD1Q8IYW4 607 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 RGL4Q8IZJ4 473 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ANKRD53Q8N9V6 530 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 CDCA5Q96FF9 252 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 RPS19P39019 145 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 DUOXA1Q1HG43 343 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 FAM198BQ6UWH4 519 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 LINGO2Q7L985 606 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 MGAT4BQ9UQ53 548 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 PCDH17O14917 1159 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 BCKDHAP12694 445 aa16.03■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa16.03■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 FBXO32Q969P5 355 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 OR2A14Q96R47 310 aa16.03■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 PCTPQ9UKL6 214 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.03■□□□□ 0.16
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