RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 KMOO15229 486 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 NOL3O60936 208 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 APODP05090 189 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 SLC35G4P0C7Q5 338 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 IL5RAQ01344 420 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 FADDQ13158 208 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 KEAP1Q14145 624 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 IQCCQ4KMZ1 466 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 SPARTQ8N0X7 666 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 AIF1LQ9BQI0 150 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 TEX101Q9BY14 249 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 WDR26Q9H7D7 661 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 MIEF1Q9NQG6 463 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 TAS2R9Q9NYW1 312 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 AHSPQ9NZD4 102 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM9Q9P0T7 183 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 SPATA7Q9P0W8 599 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ACSL6Q9UKU0 697 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 PADI2Q9Y2J8 665 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 JRKO75564 520 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ADH1BP00325 375 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 CYP4B1P13584 511 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 RBBP4Q09028 425 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 DTNBP1Q96EV8 351 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 MAGED4Q96JG8 741 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 NRTNQ99748 197 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 RHBGQ9H310 441 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 IGFLR1Q9H665 355 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 WASH6PQ9NQA3 447 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 TRPM6Q9BX84 2022 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ANKDD1BA6NHY2 528 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 SEC14L2O76054 403 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 SEMA3DO95025 777 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 C9P02748 559 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 HTR1AP08908 422 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 CDK4P11802 303 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 CXCR2P25025 360 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 CASP9P55211 416 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 TUBA3CQ13748 450 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF566Q969W8 418 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 EPYCQ99645 322 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 PCBD2Q9H0N5 130 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 SERGEFQ9UGK8 458 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 OR1A2Q9Y585 309 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 A0A1W2PRB8 838 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM229AB2RXF0 380 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 GPR89AB7ZAQ6 455 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 PLPP1O14494 284 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ATE1O95260 518 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 GPR89BP0CG08 455 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 SOAT1P35610 550 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 RXRGP48443 463 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 SCARB2Q14108 478 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 AGERQ15109 404 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 IRF4Q15306 451 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 PRSS53Q2L4Q9 553 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 TRIM40Q6P9F5 258 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 HDDC3Q8N4P3 179 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ATG16L2Q8NAA4 619 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 OR5AK3PQ8NH89 298 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 SMPDL3AQ92484 453 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 KXD1Q9BQD3 176 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 MENTQ9BUN1 341 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 RAD21L1Q9H4I0 556 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM38AQ9H6F2 299 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 KRT84Q9NSB2 600 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 CKAP5Q14008 2032 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 KLHL33A6NCF5 533 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC159P0C7I6 412 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 C5AR1P21730 350 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 CLK3P49761 638 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 CCR8P51685 355 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 CLCNKAP51800 687 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 SELENOWP63302 87 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 CYP4F2P78329 520 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 CDK5R2Q13319 367 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 ENPP2Q13822 863 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 FAHD1Q6P587 224 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 MMP21Q8N119 569 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 CNIH3Q8TBE1 160 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 MS4A8Q9BY19 250 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 RUBCNLQ9H714 662 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 TAAR2Q9P1P5 351 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 A0A1B0GVG6 124 aa22.91■■□□□ 1.26
TRIM54-201ENST00000296098 PSMB5P28074 263 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms