RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000093061.6

Trim11-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim11, Length 2,251 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11-201ENSMUST00000093061 Samd14Q8K070 417 aa15□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rnf219Q8K2Y0 722 aa15□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr1361Q8VFH0 317 aa15□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr352Q8VGJ9 315 aa15□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr575Q8VH16 318 aa15□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gpr37l1Q99JG2 481 aa15□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm26657Q9CVR1 127 aa15□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Creb3l4Q9D2A5 370 aa15□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 9030624G23RikQ9D308 155 aa15□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Usp12Q9D9M2 370 aa15□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Xylt2Q9EPL0 865 aa15□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tet2Q4JK59 1912 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Zfp992B1ASD8 573 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Zfp563B8JJZ9 448 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm8879F6R3J9 157 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Zfp607bG3X9H3 648 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rhox2hK7N6P1 191 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cacng1O70578 223 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ugt2b17P17717 530 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Prdx1P35700 199 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Hnrnpa1P49312 320 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 BckdhaP50136 442 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Erp29P57759 262 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cd80Q00609 306 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Prss57Q14B24 284 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mfsd13aQ6PDE8 519 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pik3c3Q6PF93 887 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Nudcd1Q6PIP5 582 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rap2aQ80ZJ1 183 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rbm4Q8C7Q4 361 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Zfp991Q8R1N3 573 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ccdc92Q8VDN4 314 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rbm4bQ8VE92 357 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ugt2b38Q91WH2 530 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pcdhga4Q91XY4 930 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm16286Q9CQX6 220 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Wdr55Q9CX97 388 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mgme1Q9CXC3 338 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dnajb1Q9QYJ3 340 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gpc6Q9R087 555 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Sema4fQ9Z123 777 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fbxo47A2A6H3 451 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Lzts3A2AHG0 700 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tcp10cE9Q046 482 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Vmn2r31L7N1Z4 861 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ido1P28776 407 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kcnab2P62482 367 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dab1P97318 588 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Secisbp2Q3U1C4 858 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ms4a15Q3UPL6 245 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 EndouQ3V188 412 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Clec12aQ504P2 267 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ipcef1Q5DU31 406 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 MarcoQ60754 518 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mep1bQ61847 704 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Il20raQ6PHB0 546 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Nrde2Q80XC6 1172 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rspo2Q8BFU0 243 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gpr171Q8BG55 319 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 TxlngQ8BHN1 524 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 N4bp2l2Q8JZS6 575 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 EtfdhQ921G7 616 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 PlgrktQ9D3P8 147 aa14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 MrrfQ9D6S7 262 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Smim17A0A504 109 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rad21l1A2AU37 552 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Atp6ap1lD3Z5W0 336 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ap1arE9PYF7 298 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm8922F6XVS9 199 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fmo6J3QMN6 532 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cd93O89103 644 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Arhgap39P59281 1107 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fads2p1Q0VAX3 487 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dok6Q2MHE5 331 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Defb48Q3UW22 87 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ankrd42Q3V096 527 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rnf43Q5NCP0 784 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Nadsyn1Q711T7 725 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rnf8Q8VC56 488 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr693Q8VF89 316 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Metap1dQ9CPW9 335 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Itgb3bpQ9CQ82 176 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gkn2Q9CQS6 184 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 DlstQ9D2G2 454 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Senp8Q9D2Z4 221 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Clec2gQ9D676 269 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mcemp1Q9D8U6 183 aa14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Atp5oQ9DB20 213 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tbc1d25A1A5B6 742 aa14.97□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cd300ld2A2A7W0 305 aa14.97□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rhbdl2A2AGA4 302 aa14.97□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mup18A2BIM8 181 aa14.97□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mybpc1D3YU50 1127 aa14.97□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm5861F6VCN9 180 aa14.97□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 4933402N22RikF7D1B3 190 aa14.97□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm8897L7N294 181 aa14.97□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Reps1O54916 795 aa14.97□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Mup11P04938 181 aa14.97□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ceacam1P31809 521 aa14.97□□□□□ -0.01
Trim11-201ENSMUST00000093061 Igfbp2P47877 305 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 129.2 ms