RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039517.10

Syde2-201, Transcript of Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Syde2, Length 5,495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2-201ENSMUST00000039517 Col25a1Q99MQ5 666 aa20.21■□□□□ 0.83
Syde2-201ENSMUST00000039517 Q9CZV2 255 aa20.21■□□□□ 0.83
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cldn19Q9ET38 224 aa20.21■□□□□ 0.83
Syde2-201ENSMUST00000039517 Trpm3Q5F4S9 1721 aa20.21■□□□□ 0.83
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gm21800J3QMJ9 180 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gm3099J3QPA5 205 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rps13P62301 151 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Eif5aP63242 154 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Abraxas2Q3TCJ1 415 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cbx5Q61686 191 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Kctd13Q8BGV7 329 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Angptl7Q8R1Q3 337 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Blzf1Q8R2X8 403 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tor1aQ9ER39 333 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Olfr1375A0A0N4SUP0 313 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Fam46aD3Z5S8 447 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Galntl6E5D8G1 601 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cyp2w1E9Q816 493 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Qsox2Q3TMX7 692 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 P4ha2Q60716 537 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Olfr1085Q7TR64 313 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Psmf1Q8BHL8 271 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Znf786Q8BV42 777 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tpra1Q99MU1 369 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 CasrQ9QY96 1079 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Armc4B2RY50 1037 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Il6raP22272 460 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tacr2P30549 384 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 ThpoP40226 356 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Lemd2Q6DVA0 511 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cnih3Q6ZWS4 160 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tas2r110Q7M712 333 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Syt14Q7TN84 555 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Lrrc66Q8K0B3 872 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Lrrc56Q8K375 552 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ndufs4Q9CXZ1 175 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Subh2bvQ9D9Z7 123 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 B3galt5Q9JI67 308 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ccdc86Q9JJ89 426 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Auts2A0A087WPF7 1261 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 AldoaP05064 364 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Alkbh2Q6P6J4 239 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ostm1Q8BGT0 338 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 B3gnt5Q8BGY6 376 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Olfml2aQ8BHP7 681 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gm26657Q9CVR1 127 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Sapcd1Q9CY86 146 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Arfgap1Q9EPJ9 414 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gm3854A0A1B0GSS6 495 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ralgps1A2AR50 585 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gp6P0C191 313 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Il18P70380 192 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Pnliprp1Q5BKQ4 473 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Olfm2Q8BM13 448 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ca5bQ9QZA0 317 aa20.2■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Spaca6E9Q8Q8 339 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 TP20293 436 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Fscn2Q32M02 492 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Znf182Q6P560 627 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 NaxeQ8K4Z3 282 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ambra1A2AH22 1300 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Olfr1253A2AUA2 318 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Hoxa10P31310 416 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 RptnP97347 1118 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 C2cd4cC2CD4Q5HZI2 419 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Olfr1251Q7TQZ3 318 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Olfr384Q7TRX8 312 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Fam181bQ80VF6 417 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gpc2Q8BKV1 579 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Emc3Q99KI3 261 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ovca2Q9D7E3 225 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Fank1Q9DAM9 344 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Calm4Q9JM83 148 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 F9P16294 471 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Id2P41136 134 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Lrrn1Q61809 716 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gm5346Q7M766 736 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Chrnb3Q8BMN3 464 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 E330021D16RikQ8BW45 371 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Hbp1Q8R316 516 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rnf130Q8VEM1 419 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Coro6Q920M5 471 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Sp2Q9D2H6 612 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Med27Q9DB40 311 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rsc1a1Q9ER99 582 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cyp2j8G3UZ38 503 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tlx3O55144 291 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tcea1P10711 301 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Lmf1Q3U3R4 574 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Sim1Q61045 765 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ppp1r26Q6A025 1163 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Slc45a1Q8BIV7 751 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Sumf2Q8BPG6 308 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Zmynd11Q8R5C8 602 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Slco1c1Q9ERB5 715 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rgs17Q9QZB0 210 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Map2k5Q9WVS7 448 aa20.19■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Olfr618K7N6B3 318 aa20.18■□□□□ 0.82
Syde2-201ENSMUST00000039517 Akt2Q60823 481 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29 ms