RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, human

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PIK3C3-211	ENST00000589550	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	SNTA1	Q13424	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	ELP5	Q8TE02	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	GLYATL1	Q969I3	302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	GPA33	Q99795	319 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550		H3BMM5	538 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	CHEK1	O14757	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	KRT33A	O76009	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	OPN1MW	P04001	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	GSTA2	P09210	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	CETP	P11597	493 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	FGF5	P12034	268 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	SCP2	P22307	547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	FCAR	P24071	287 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	EPHA2	P29317	976 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	TNFRSF4	P43489	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	TRPC1	P48995	793 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	HERV-K104	P61576	105 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	GABPA	Q06546	454 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	OVGP1	Q12889	678 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	SNX1	Q13596	522 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	CDH18	Q13634	790 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	TRIM29	Q14134	588 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	PDIA5	Q14554	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	HERC3	Q15034	1050 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	DCAF10	Q5QP82	559 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZNF573	Q86YE8	665 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	GANC	Q8TET4	914 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	SCRN2	Q96FV2	425 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	FICD	Q9BVA6	458 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-211	ENST00000589550	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-211	ENST00000589550	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-211	ENST00000589550	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-211	ENST00000589550	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-211	ENST00000589550		A0A0U1RRA0	63 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-211	ENST00000589550		H0YCG3	227 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-211	ENST00000589550	LRP3	O75074	770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-211	ENST00000589550	PALM	O75781	387 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-211	ENST00000589550	CT45A8	P0DMV1	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-211	ENST00000589550	CT45A9	P0DMV2	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-211	ENST00000589550	THRB	P10828	461 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-211	ENST00000589550	PRG2	P13727	222 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-211	ENST00000589550	LHCGR	P22888	699 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-211	ENST00000589550	MYL7	Q01449	175 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms