RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ATP1A4Q13733 1029 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 VEZF1Q14119 521 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PDK3Q15120 406 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PDK4Q16654 411 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 GSTA3Q16772 222 aa2.94□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 C10orf88Q9H8K7 445 aa2.94□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 S100A14Q9HCY8 104 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MMP25Q9NPA2 562 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SERHLQ9NQF3 203 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 NECTIN3Q9NQS3 549 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PRDM8Q9NQV8 689 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ABCB10Q9NRK6 738 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP2.94□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 HIF1ANQ9NWT6 349 aa2.94□□□□□ -1.94
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