RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 CLDN8P56748 225 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 PHEXP78562 749 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 ARMC6Q6NXE6 501 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 GALNT18Q6P9A2 607 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 AMER3Q8N944 861 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 OR6C4Q8NGE1 309 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 NMRK1Q9NWW6 199 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 MAP10Q9P2G4 905 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 PADI4Q9UM07 663 aa20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM234BA2RU67 622 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 GSC2O15499 205 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 KLK1P06870 262 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 GLB1P16278 677 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 SDHBP21912 280 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 SERPINB1P30740 379 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 RASSF2P50749 326 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 DGKQP52824 942 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 RCAN2Q14206 197 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 SPIN4Q56A73 249 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 RIMKLAQ8IXN7 391 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 OR4N4Q8N0Y3 316 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 CDC6Q99741 560 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 MAP3K3Q99759 626 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM60AQ9NP50 221 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 FTSJ1Q9UET6 329 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 A0A0J9YVX5 310 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 GYG2O15488 501 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 EEDO75530 441 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 LRATO95237 230 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 BSGP35613 385 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 GFERP55789 205 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 TLR1Q15399 786 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 NR0B2Q15466 257 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 REP15Q6BDI9 236 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 FRMPD2BQ6IN97 320 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 IRGCQ6NXR0 463 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM92BQ6ZTR7 304 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 NCSTNQ92542 709 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 SPDL1Q96EA4 605 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 DPY30Q9C005 99 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 C1orf21Q9H246 121 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 SEMA6CQ9H3T2 930 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 RP1P56715 2156 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDH7O60245 1069 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 MAPK1P28482 360 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 MNAT1P51948 309 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 CORO7P57737 925 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 PHC1P78364 1004 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 DAB2P98082 770 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 ADPRMQ3LIE5 342 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 KLHL35Q6PF15 583 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 TTLQ8NG68 377 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 TM4SF19Q96DZ7 209 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 CLMPQ9H6B4 373 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 PIEZO1Q92508 2521 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 A0A0G2JN53 185 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 NDUFS4O43181 175 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 AKAP10O43572 662 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 FKBP9O95302 570 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 CTSBP07858 339 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 NUDT2P50583 147 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 MXRA7P84157 204 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 STX5Q13190 355 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 MAPRE2Q15555 327 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 PROX2Q3B8N5 592 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 PAGE3Q5JUK9 113 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 DSELQ8IZU8 1212 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 KCT2Q8NC54 265 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 TRPV3Q8NET8 790 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC13A3Q8WWT9 602 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 MS4A6EQ96DS6 147 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 EFCAB1Q9HAE3 211 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKMY1Q9P2S6 941 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 A0A1W2PP18 115 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-209ENST00000532457 P2RX6O15547 441 aa20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms