RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512331.5

RUFY3-210, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene RUFY3, Length 866 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-210ENST00000512331 ADAM20O43506 726 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 UGT1A9O60656 530 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CDH16O75309 829 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CLDN11O75508 207 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 SPAG6O75602 509 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 NEBLO76041 1014 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 PRAMEF12O95522 483 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 MMP2P08253 660 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 PRR35P0CG20 571 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CEBPBP17676 345 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 PGAM1P18669 254 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 TNFRSF1AP19438 455 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 HOXA9P31269 272 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 STX2P32856 288 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 ADRA1AP35348 466 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 MMP13P45452 471 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 SOX2P48431 317 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 IFNAR2P48551 515 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 GEMP55040 296 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 GALNT3Q14435 633 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 PLK5Q496M5 336 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 FSCBQ5H9T9 825 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CASC4Q6P4E1 433 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 KDELC1Q6UW63 502 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CES3Q6UWW8 571 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 TDRPQ86YL5 185 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 TEX26Q8N6G2 289 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 POC5Q8NA72 575 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 FAR1Q8WVX9 515 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 ING5Q8WYH8 240 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 LRRC39Q96DD0 335 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CCDC77Q9BR77 488 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 OR10A4Q9H209 315 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 DONSONQ9NYP3 566 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CCL26Q9Y258 94 aa6.35□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 MYO10Q9HD67 2058 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 ILVBLA1L0T0 632 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CXorf65A6NEN9 183 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 SDR42E2A6NKP2 422 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 FAM159BA6NKW6 160 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 UBE2CO00762 179 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 RRHO14718 337 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 PSMD3O43242 534 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 KDELR3O43731 214 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 SNAP91O60641 907 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 ANXA9O76027 345 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 GSTA2P09210 222 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 PTPN2P17706 415 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 HOXA5P20719 270 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 EDN2P20800 178 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CSKP41240 450 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CD86P42081 329 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 MSH2P43246 934 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 RGRP47804 291 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 NRIP1P48552 1158 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 GNGT1P63211 74 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 ARF5P84085 180 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CDH17Q12864 832 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 ZNF235Q14590 738 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 CDSNQ15517 529 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 DUSP6Q16828 381 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 MARC1Q5VT66 337 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.34□□□□□ -1.39
RUFY3-210ENST00000512331 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms