RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411398.1

RNU6-1052P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1052, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1052P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HACD3Q9P035 362 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TBX21Q9UL17 535 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PDE10AQ9Y233 779 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CHKBQ9Y259 395 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SHANK1Q9Y566 2161 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LRRK1Q38SD2 2015 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KMT2EQ8IZD2 1858 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DOCK9Q9BZ29 2069 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM166BA8MTA8 275 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TSPAN4O14817 238 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LRRTM2O43300 516 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF749O43361 778 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HCRTR2O43614 444 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TSPAN1O60635 241 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR6B1O95007 311 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PDGFRBP09619 1106 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DLATP10515 647 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KRT3P12035 628 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM11P17152 192 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACSL1P33121 698 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RPS10P46783 165 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC1A6P48664 564 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LBX1P52954 281 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AK2P54819 239 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GGTLC2Q14390 218 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MELKQ14680 651 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IRF4Q15306 451 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCNG2Q16589 344 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CNPY1Q3B7I2 92 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ADCK5Q3MIX3 580 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NHSL2Q5HYW2 709 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EOGTQ5NDL2 527 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DNLZQ5SXM8 178 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DCST2Q5T1A1 773 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC22A10Q63ZE4 541 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM198Q66K66 360 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AACSQ86V21 672 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MCEMP1Q8IX19 187 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCDC26Q8TAB7 109 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UBALD1Q8TB05 177 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CASP10Q92851 521 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 VSIG2Q96IQ7 327 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LURAP1Q96LR2 239 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR6C1Q96RD1 312 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RPS6KC1Q96S38 1066 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 APMAPQ9HDC9 416 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GKN1Q9NS71 199 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KCND2Q9NZV8 630 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OPN4Q9UHM6 478 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DAPK2Q9UIK4 370 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF148Q9UQR1 794 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 COL6A6A6NMZ7 2263 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LRP4O75096 1905 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 USP27XA6NNY8 438 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SCAMP1O15126 338 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ARPC2O15144 300 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PLXNB1O43157 2135 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPAG7O75391 227 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MMP23AO75900 390 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NKX2-2O95096 273 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ATP1B1P05026 303 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NUDT17P0C025 328 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CISD3P0C7P0 127 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CD1DP15813 335 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACADLP28330 430 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PGM1P36871 562 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACVR1BP36896 505 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HADHAP40939 763 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ALDH3B1P43353 468 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PNLIPRP2P54317 469 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ICA1Q05084 483 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLAQ13239 276 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CUL4BQ13620 913 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GIT2Q14161 759 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GALEQ14376 348 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HERPUD1Q15011 391 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RASA2Q15283 850 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NFIL3Q16649 462 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DUSP5Q16690 384 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PPP1R3AQ16821 1122 aa-0.3□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms