RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047697.11

Trim17-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

TSL 2 BASIC

Gene Trim17, Length 3,664 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17-201ENSMUST00000047697 Upf3aQ3ULJ3 422 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Chsy3Q5DTK1 884 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Tmem255bQ5FW56 369 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 NapepldQ8BH82 396 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 SynbQ8BI41 618 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Rgs7bpQ8BQP9 257 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Cfap61Q8CEL2 1252 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Olfr398Q8VFY0 314 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Tmem269Q9D4Y8 254 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Atp5oQ9DB20 213 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Uqcrc2Q9DB77 453 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Cst9Q9Z0H6 137 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Cldn9Q9Z0S7 217 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Pld1Q9Z280 1074 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Ice1E9Q286 2241 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Gm4775F7ANJ3 135 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Gm8334F7CD45 553 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Kpna3O35344 521 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Neurog1P70660 244 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Pin1rt1Q3ULQ2 159 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Snta1Q61234 503 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Arnt2Q61324 712 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Chst8Q8BQ86 417 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Tmem259Q8CIV2 574 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 RbksQ8R1Q9 323 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Olfr622Q8VGY7 317 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Arrb2Q91YI4 410 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 AmnQ99JB7 458 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Cyp4f13Q99N19 523 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Vsig1Q9D2J4 407 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Rhox2aQ9D4Y3 191 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Vps29Q9QZ88 182 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Gm29106A0A087WSP8 697 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Olfr592E9PYB3 312 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Hps1O08983 704 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 LifP09056 203 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 AcadvlP50544 656 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Arf5P84084 180 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Smad5P97454 465 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Tmem184cQ3TPR7 525 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Trpc5osQ3UHV4 110 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Zc3h12aQ5D1E7 596 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 St8sia4Q64692 359 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Olig3Q6PFG8 273 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Trim45Q6PFY8 580 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Olfr1152Q7TR34 310 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Ak6Q8VCP8 172 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Q91V76 315 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Acsl6Q91WC3 697 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Gorasp1Q91X51 446 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Pdzd3Q99MJ6 498 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Snx7Q9CY18 387 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Q9D454 513 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Prmt1Q9JIF0 371 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Slc5a3Q9JKZ2 718 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Atp6ap1Q9R1Q9 463 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Deaf1Q9Z1T5 566 aa10□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Gm7945F6QI24 236 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Vmn2r8L7N472 848 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 PbsnO08976 174 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Hnf1bP27889 558 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Cfl2P45591 166 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Ubxn2bQ0KL01 331 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Spryd7Q3TFQ1 196 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Q3UY34 256 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Mylk4Q5SUV5 386 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Pkp4Q68FH0 1190 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Cdh24Q6PFX6 781 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Il20raQ6PHB0 546 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Proser3Q7TSA6 634 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Q8K207 121 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 St7lQ8K4P7 559 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Pla2g15Q8VEB4 412 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Mtfr2Q8VED8 361 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Recql5Q8VID5 982 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 As3mtQ91WU5 376 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Mgme1Q9CXC3 338 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Tnfrsf21Q9EPU5 655 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 HnrnpfQ9Z2X1 415 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Gm16432A0A0A6YXX9 775 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Krt28A6BLY7 462 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Gm4969D3YZT1 566 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 DcnP28654 354 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Prelid2Q0VBB0 177 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Myl12bQ3THE2 172 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Cpxcr1Q3V0P1 322 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Slc29a2Q61672 456 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Sqstm1Q64337 442 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Syt16Q7TN83 639 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Oog2Q7TPX8 476 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Q810M1 233 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 PdhxQ8BKZ9 501 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Larp4Q8BWW4 719 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Znf322Q8BZ89 410 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Ccdc142Q8CAI1 738 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Dppa4Q8CCG4 296 aa9.99□□□□□ -0.81
Trim17-201ENSMUST00000047697 Swi5Q8K3D3 89 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.3 ms