Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H6

Cst9, Cystatin-9, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cst9Q9Z0H6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Cst9Q9Z0H6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cst9Q9Z0H6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cst9Q9Z0H6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cst9Q9Z0H6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cst9Q9Z0H6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cst9Q9Z0H6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Cst9Q9Z0H6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Cst9Q9Z0H6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cst9Q9Z0H6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Cst9Q9Z0H6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Cst9Q9Z0H6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cst9Q9Z0H6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Cst9Q9Z0H6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cst9Q9Z0H6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cst9Q9Z0H6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cst9Q9Z0H6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Cst9Q9Z0H6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cst9Q9Z0H6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cst9Q9Z0H6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cst9Q9Z0H6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cst9Q9Z0H6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cst9Q9Z0H6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cst9Q9Z0H6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cst9Q9Z0H6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cst9Q9Z0H6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cst9Q9Z0H6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Cst9Q9Z0H6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cst9Q9Z0H6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cst9Q9Z0H6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cst9Q9Z0H6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cst9Q9Z0H6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cst9Q9Z0H6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Cst9Q9Z0H6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cst9Q9Z0H6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cst9Q9Z0H6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cst9Q9Z0H6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cst9Q9Z0H6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cst9Q9Z0H6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cst9Q9Z0H6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cst9Q9Z0H6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cst9Q9Z0H6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cst9Q9Z0H6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cst9Q9Z0H6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cst9Q9Z0H6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cst9Q9Z0H6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Cst9Q9Z0H6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cst9Q9Z0H6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cst9Q9Z0H6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cst9Q9Z0H6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cst9Q9Z0H6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cst9Q9Z0H6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cst9Q9Z0H6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cst9Q9Z0H6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cst9Q9Z0H6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cst9Q9Z0H6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cst9Q9Z0H6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cst9Q9Z0H6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cst9Q9Z0H6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cst9Q9Z0H6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cst9Q9Z0H6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cst9Q9Z0H6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cst9Q9Z0H6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cst9Q9Z0H6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cst9Q9Z0H6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cst9Q9Z0H6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cst9Q9Z0H6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cst9Q9Z0H6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cst9Q9Z0H6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cst9Q9Z0H6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cst9Q9Z0H6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cst9Q9Z0H6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cst9Q9Z0H6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cst9Q9Z0H6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cst9Q9Z0H6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cst9Q9Z0H6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cst9Q9Z0H6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cst9Q9Z0H6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cst9Q9Z0H6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cst9Q9Z0H6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cst9Q9Z0H6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cst9Q9Z0H6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cst9Q9Z0H6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cst9Q9Z0H6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cst9Q9Z0H6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cst9Q9Z0H6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cst9Q9Z0H6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cst9Q9Z0H6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cst9Q9Z0H6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cst9Q9Z0H6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cst9Q9Z0H6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cst9Q9Z0H6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cst9Q9Z0H6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cst9Q9Z0H6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cst9Q9Z0H6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cst9Q9Z0H6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cst9Q9Z0H6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cst9Q9Z0H6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cst9Q9Z0H6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cst9Q9Z0H6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms