RNA–Protein interactions for RNA: YPL066W

RGL1, Transcript of Regulator of Rho1p signaling, cofactor of Tus1p, yeast

Gene RGL1, Length 1,440 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGL1	YPL066W	ATG13	Q06628	738 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGL1	YPL066W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	AIM21	P40563	679 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	HFM1	P51979	1187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	XYL2	Q07993	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	PEP7	P32609	515 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	MGE1	P38523	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	PLB1	P39105	664 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	POL32	P47110	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	KIN4	Q01919	800 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	SLA2	P33338	968 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	CHS7	P38843	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	TPO1	Q07824	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	MSS4	P38994	779 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	MND2	P40577	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	ACM1	Q08981	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	GNT1	Q12096	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	DCG1	P32460	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	YJR107W	P47145	328 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	CTF4	Q01454	927 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RGL1	YPL066W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	PNT1	P38969	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	MTC3	P53077	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	ADY3	Q07732	790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	ENA1	P13587	1091 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	GEM1	P39722	662 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	RRT14	P40470	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	RAD53	P22216	821 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	RAD27	P26793	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	POA1	P38218	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	YML020W	Q03722	664 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	DUT1	P33317	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	YPT53	P36019	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	MET12	P46151	657 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	HIS5	P07172	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	HEM3	P28789	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	ASF1	P32447	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	EEB1	Q02891	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
RGL1	YPL066W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	YKL151C	P36059	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	INO1	P11986	533 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	LYP1	P32487	611 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	CHA4	P43634	648 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	EXG2	P52911	562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGL1	YPL066W	YAP1801	P38856	637 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	SRP101	P32916	621 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	YGL176C	P46945	554 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	CDA1	Q06702	301 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	OSW2	Q12202	724 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	LAS17	Q12446	633 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	RMD1	Q03441	430 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	TYW3	P53177	273 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	YGR012W	P53206	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	ESC2	Q06340	456 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	PPM2	Q08282	695 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	SPE1	P08432	466 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	MDM38	Q08179	573 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	AIM39	Q08223	395 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	CDC34	P14682	295 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	GIC1	P38785	314 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	NPP2	P39997	493 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	YML122C	Q03207	126 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	NPC2	Q12408	173 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	YKL107W	P34251	309 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	MOH1	P38191	138 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	IOC3	P43596	787 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	RKM4	Q12504	494 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RGL1	YPL066W	SRT1	Q03175	343 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RGL1	YPL066W	PET112	P33893	541 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RGL1	YPL066W	OAR1	P35731	278 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RGL1	YPL066W	BUL1	P48524	976 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RGL1	YPL066W	NCS6	P53088	359 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RGL1	YPL066W	KAR4	P25583	335 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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