RNA–Protein interactions for RNA: YOL007C

CSI2, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene CSI2, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI2	YOL007C	KIN4	Q01919	800 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CSI2	YOL007C	MCM2	P29469	868 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CSI2	YOL007C	PEP7	P32609	515 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CSI2	YOL007C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CSI2	YOL007C	MSS4	P38994	779 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CSI2	YOL007C	PLB1	P39105	664 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CSI2	YOL007C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CSI2	YOL007C	RAD53	P22216	821 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CSI2	YOL007C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CSI2	YOL007C	MCM7	P38132	845 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CSI2	YOL007C	MND2	P40577	368 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CSI2	YOL007C	HFM1	P51979	1187 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CSI2	YOL007C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CSI2	YOL007C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CSI2	YOL007C	TPO1	Q07824	586 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CSI2	YOL007C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CSI2	YOL007C	RER2	P35196	286 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	ACM1	Q08981	209 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	GNT1	Q12096	491 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	SLA2	P33338	968 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	RRT14	P40470	206 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	SPR28	Q04921	423 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	ADY3	Q07732	790 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	XYL2	Q07993	356 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	POA1	P38218	177 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	GEM1	P39722	662 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	ZRG8	P40021	1076 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	MET12	P46151	657 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	HIS5	P07172	385 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	ENA1	P13587	1091 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	MGE1	P38523	228 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	PNT1	P38969	423 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	FYV10	P40492	516 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	MTC3	P53077	123 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	ENA2	Q01896	1091 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	ENA5	Q12691	1091 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CSI2	YOL007C	ATE1	P16639	503 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	RAD27	P26793	382 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	POL32	P47110	350 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	EXG2	P52911	562 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	RTT10	Q08924	1013 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	CHA4	P43634	648 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	YJR107W	P47145	328 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	IOC3	P43596	787 aa		5	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	YML122C	Q03207	126 aa		5	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	PPM2	Q08282	695 aa		5	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	KCS1	Q12494	1050 aa		5	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	SLD2	P34252	453 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	YAP1801	P38856	637 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	AIM39	Q08223	395 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	MOH1	P38191	138 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	OSW2	Q12202	724 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	LYP1	P32487	611 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	OAR1	P35731	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	CDA1	Q06702	301 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	LAS17	Q12446	633 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSI2	YOL007C	INO1	P11986	533 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	DUT1	P33317	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	YKL151C	P36059	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	YGR012W	P53206	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
CSI2	YOL007C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	SPE1	P08432	466 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	SRP101	P32916	621 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	EEB1	Q02891	456 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	NPC2	Q12408	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	YGL176C	P46945	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	MDM38	Q08179	573 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	BUL1	P48524	976 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	UBA2	P52488	636 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	NCS6	P53088	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	TYW3	P53177	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	RKM4	Q12504	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	YKL107W	P34251	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	GIC1	P38785	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	CCC2	P38995	1004 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	SRT1	Q03175	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	ENB1	Q08299	606 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSI2	YOL007C	HSF1	P10961	833 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSI2	YOL007C	KAR4	P25583	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSI2	YOL007C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSI2	YOL007C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSI2	YOL007C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSI2	YOL007C	CDC34	P14682	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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