RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	INO1	P11986	533 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	BAS1	P22035	811 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	CDC20	P26309	610 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	APL1	P27351	700 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	TYW3	P53177	273 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	YLR358C	O13565	187 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	UGA2	P38067	497 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	VAC8	P39968	578 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	MTC3	P53077	123 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	CWC24	P53769	259 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	RSM24	Q03976	319 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	XYL2	Q07993	356 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	BI4	P03879	638 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	SLA2	P33338	968 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	LST4	P34239	828 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	YKL151C	P36059	337 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	TAT2	P38967	592 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	PNT1	P38969	423 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	YGL176C	P46945	554 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	HNT2	P49775	206 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	HFM1	P51979	1187 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	YGR053C	P53234	283 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	ACE2	P21192	770 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
YLR224W	YLR224W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	ENV11	P53246	860 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	GPB1	Q08886	897 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	ATG13	Q06628	738 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	GNT1	Q12096	491 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	YKL107W	P34251	309 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	MBP1	P39678	833 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	MSC2	Q03455	724 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	SPO20	Q04359	397 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	TMA10	Q06177	86 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YLR224W	YLR224W	EMC1	P25574	760 aa		4.33	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	VPS62	P53285	467 aa		4.33	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	YAP6	Q03935	383 aa		4.33	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.33	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	OPI10	Q08202	246 aa		4.33	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	ACM1	Q08981	209 aa		4.33	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	RKM4	Q12504	494 aa		4.33	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	DOM34	P33309	386 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	PHO23	P50947	330 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	VBA5	P36172	582 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	GEM1	P39722	662 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	NPP2	P39997	493 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	SLI1	P53304	468 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	RXT3	Q07458	294 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	HMI1	Q12039	706 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	AGP1	P25376	633 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	TPO1	Q07824	586 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	STE5	P32917	917 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	PLB1	P39105	664 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	MND2	P40577	368 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	SUN4	P53616	420 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.28	□□□□□ -1.72	not detected
YLR224W	YLR224W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YLR224W	YLR224W	ERT1	P38140	529 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	RRT14	P40470	206 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	GIS1	Q03833	894 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	SHE9	Q04172	456 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	ADY3	Q07732	790 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	HCM1	P25364	564 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	MRP8	P35719	219 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	GIC1	P38785	314 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	YAP1801	P38856	637 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	YJL049W	P47048	450 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	MDM38	Q08179	573 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	PUS9	Q12069	462 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	ENA1	P13587	1091 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	SFB2	P53953	876 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	NTO1	Q12311	748 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLR224W	YLR224W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45 ms