RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 ATP6V1AP38606 617 aa26.9■■□□□ 1.9
CSAG3-202ENST00000617158 NBPF14Q5TI25 921 aa26.9■■□□□ 1.9
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.9■■□□□ 1.9
CSAG3-202ENST00000617158 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CSAG3-202ENST00000617158 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.9■■□□□ 1.9
CSAG3-202ENST00000617158 NBPF15Q8N660 670 aa26.9■■□□□ 1.9
CSAG3-202ENST00000617158 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.9■■□□□ 1.9
CSAG3-202ENST00000617158 CACNA1FO60840 1977 aa26.89■■□□□ 1.9
CSAG3-202ENST00000617158 APBA3O96018 575 aa26.89■■□□□ 1.9
CSAG3-202ENST00000617158 ANXA1P04083 346 aa26.89■■□□□ 1.9
CSAG3-202ENST00000617158 A1BGP04217 495 aa26.89■■□□□ 1.9
CSAG3-202ENST00000617158 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
CSAG3-202ENST00000617158 G2E3Q7L622 706 aa26.89■■□□□ 1.9
CSAG3-202ENST00000617158 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.89■■□□□ 1.9
CSAG3-202ENST00000617158 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.89■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 PLSCR1O15162 318 aa26.88■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.88■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.88■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 SLC4A2P04920 1241 aa26.86■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 TNNQ9UQP3 1299 aa26.84■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 PLIN1O60240 522 aa26.83■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 TXNRD1Q16881 649 aa26.83■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 ERBB4Q15303 1308 aa26.83■■□□□ 1.89
CSAG3-202ENST00000617158 STARD3NLO95772 234 aa26.82■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 ILDR2Q71H61 639 aa26.82■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 STK31Q9BXU1 1019 aa26.82■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.82■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 C4BP0C0L5 1744 aa26.82■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.81■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.8■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 MYL6BP14649 208 aa26.79■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.79■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.79■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.79■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 FLIIQ13045 1269 aa26.77■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.77■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 HYPKQ9NX55 129 aa26.77■■□□□ 1.88
CSAG3-202ENST00000617158 KIF16BQ96L93 1317 aa26.76■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.76■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.76■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.75■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 TRIM27P14373 513 aa26.74■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 SMIM5Q71RC9 77 aa26.74■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 COPS6Q7L5N1 327 aa26.74■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.74■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.74■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.73■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 RLBP1P12271 317 aa26.73■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.73■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.73■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 ADCY9O60503 1353 aa26.72■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.72■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC125Q86Z20 511 aa26.72■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 PTPRCP08575 1304 aa26.71■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.71■■□□□ 1.87
CSAG3-202ENST00000617158 F6X3S4 739 aa26.7■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 BAG6P46379 1132 aa26.7■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 RPS6KA4O75676 772 aa26.69■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF827Q17R98 1081 aa26.69■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 AKT1S1Q96B36 256 aa26.69■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.69■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 ABCC4O15439 1325 aa26.68■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 PANK1Q8TE04 598 aa26.68■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.68■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.67■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.67■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 C4AP0C0L4 1744 aa26.66■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 GNPATO15228 680 aa26.66■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 KSR2Q6VAB6 950 aa26.66■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 COL15A1P39059 1388 aa26.66■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 PDE3AQ14432 1141 aa26.65■■□□□ 1.86
CSAG3-202ENST00000617158 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms