RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608306.5

LINC00635-217, long intergenic non-protein coding RNA 635, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00635, Length 873 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00635-217ENST00000608306 FLAD1Q8NFF5 587 aa11.56□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 MTHFSP49914 203 aa11.55□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 CABP4P57796 275 aa11.55□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 AMOTQ4VCS5 1084 aa11.55□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.55□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 DCAF5Q96JK2 942 aa11.55□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 ATG3Q9NT62 314 aa11.55□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 IL13P35225 146 aa11.54□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.54□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.54□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 LY75O60449 1722 aa11.54□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa11.54□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 ERVV-2B6SEH9 535 aa11.53□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 RGL2O15211 777 aa11.53□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 GNPATO15228 680 aa11.53□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 HMOX1P09601 288 aa11.53□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 ITPK1Q13572 414 aa11.53□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.52□□□□□ -0.56
LINC00635-217ENST00000608306 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 SSFA2P28290 1259 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 ITGB4P16144 1822 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 MAP3K5Q99683 1374 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 TRAPPC3LQ5T215 181 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 C5P01031 1676 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 AKAP4Q5JQC9 854 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 SLC4A9Q96Q91 983 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 LGR6Q9HBX8 967 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 C4BP0C0L5 1744 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 QSER1Q2KHR3 1735 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.47□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 KDRP35968 1356 aa11.46□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 RFC4P35249 363 aa11.46□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
LINC00635-217ENST00000608306 RNMTO43148 476 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 GRIN3BO60391 1043 aa11.45□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 MMP10P09238 476 aa11.45□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 TAF1LQ8IZX4 1826 aa11.44□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 RPS6KA4O75676 772 aa11.44□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 CRKLP46109 303 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 SLC39A6Q13433 755 aa11.44□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 CFAP53Q96M91 514 aa11.44□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 SLC52A2Q9HAB3 445 aa11.44□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.43□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa11.42□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 DNAJC10Q8IXB1 793 aa11.42□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa11.41□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 GYS1P13807 737 aa11.41□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.41□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 NUDCQ9Y266 331 aa11.41□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 COL24A1Q17RW2 1714 aa11.4□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 UBR3Q6ZT12 1888 aa11.4□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 GNAT3A8MTJ3 354 aa11.4□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 STK25O00506 426 aa11.4□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 TEFQ10587 303 aa11.4□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 TTC5Q8N0Z6 440 aa11.4□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 GAS2L2Q8NHY3 880 aa11.4□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 CCDC87Q9NVE4 849 aa11.4□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 STK24Q9Y6E0 443 aa11.4□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.4□□□□□ -0.58
LINC00635-217ENST00000608306 UTRNP46939 3433 aa11.4□□□□□ -0.59
LINC00635-217ENST00000608306 A0A0G2JLW4 131 aa11.39□□□□□ -0.59
LINC00635-217ENST00000608306 ZPR1O75312 459 aa11.39□□□□□ -0.59
LINC00635-217ENST00000608306 PPP2R1AP30153 589 aa11.39□□□□□ -0.59
LINC00635-217ENST00000608306 PRKAR2BP31323 418 aa11.39□□□□□ -0.59
LINC00635-217ENST00000608306 PHACTR3Q96KR7 559 aa11.39□□□□□ -0.59
LINC00635-217ENST00000608306 CANXP27824 592 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
LINC00635-217ENST00000608306 IL17REQ8NFR9 667 aa11.38□□□□□ -0.59
LINC00635-217ENST00000608306 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
LINC00635-217ENST00000608306 USPL1Q5W0Q7 1092 aa11.37□□□□□ -0.59
LINC00635-217ENST00000608306 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.37□□□□□ -0.59
LINC00635-217ENST00000608306 BCS1LQ9Y276 419 aa11.37□□□□□ -0.59
LINC00635-217ENST00000608306 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
LINC00635-217ENST00000608306 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.8 ms