RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604073.1

KIAA0391-208, Transcript of KIAA0391, human

TSL 3

Gene KIAA0391, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIAA0391-208	ENST00000604073	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	RUNDC1	Q96C34	613 aa		11.51	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	MRS2	Q9HD23	443 aa		11.51	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	APAF1	O14727	1248 aa		11.5	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	RPS6KA4	O75676	772 aa		11.5	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	SSFA2	P28290	1259 aa		11.5	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		11.5	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	USP16	Q9Y5T5	823 aa		11.5	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	A1BG	P04217	495 aa		11.49	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	KRT24	Q2M2I5	525 aa		11.49	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		11.49	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	NEFM	P07197	916 aa		11.48	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	FKBP8	Q14318	412 aa		11.48	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		11.48	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	ARX	Q96QS3	562 aa		11.48	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	GYS1	P13807	737 aa		11.47	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		11.47	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		11.47	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.47	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		11.47	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		11.47	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		11.47	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	COL15A1	P39059	1388 aa		11.46	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.46	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.46	□□□□□ -0.57
KIAA0391-208	ENST00000604073	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	DDR1	Q08345	913 aa		11.45	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		11.45	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.45	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	SYT17	Q9BSW7	474 aa		11.45	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		11.45	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		11.45	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	MMP10	P09238	476 aa		11.44	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	RFC4	P35249	363 aa		11.44	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		11.44	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		11.43	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	CHL1	O00533	1208 aa		11.43	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	POLD1	P28340	1107 aa		11.43	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		11.43	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		11.43	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	SCN7A	Q01118	1682 aa		11.43	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	STARD3NL	O95772	234 aa		11.42	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	ANXA1	P04083	346 aa		11.42	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	PROSER3	Q2NL68	480 aa		11.42	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	NECTIN2	Q92692	538 aa		11.42	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		11.42	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	ZNF853	P0CG23	659 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	NGEF	Q8N5V2	710 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	MBIP	Q9NS73	344 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	NARF	Q9UHQ1	456 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	CAMTA2	O94983	1202 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	NFIX	Q14938	502 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
KIAA0391-208	ENST00000604073	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		11.4	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	MYL6B	P14649	208 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	TM4SF1	P30408	202 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	PDIA6	Q15084	440 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	WWC1	Q8IX03	1113 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	MIER1	Q8N108	512 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	ZPR1	O75312	459 aa		11.38	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	11.38	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	HLF	Q16534	295 aa		11.38	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		11.38	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	CFAP44	Q96MT7	982 aa		11.38	□□□□□ -0.59
KIAA0391-208	ENST00000604073	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		11.38	□□□□□ -0.59

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