RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590466.2

UBXN6-206, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-206ENST00000590466 RUNDC1Q96C34 613 aa26.71■■□□□ 1.87
UBXN6-206ENST00000590466 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.69■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.69■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 C4AP0C0L4 1744 aa26.68■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 MMP10P09238 476 aa26.66■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 USP16Q9Y5T5 823 aa26.66■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.65■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 ANP32CO43423 234 aa26.65■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 KLHL34Q8N239 644 aa26.65■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.65■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 COL15A1P39059 1388 aa26.64■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.64■■□□□ 1.86
UBXN6-206ENST00000590466 A1BGP04217 495 aa26.63■■□□□ 1.85
UBXN6-206ENST00000590466 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.63■■□□□ 1.85
UBXN6-206ENST00000590466 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.63■■□□□ 1.85
UBXN6-206ENST00000590466 FKBP8Q14318 412 aa26.62■■□□□ 1.85
UBXN6-206ENST00000590466 NARFQ9UHQ1 456 aa26.62■■□□□ 1.85
UBXN6-206ENST00000590466 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
UBXN6-206ENST00000590466 NEUROD2Q15784 382 aa26.61■■□□□ 1.85
UBXN6-206ENST00000590466 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
UBXN6-206ENST00000590466 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.6■■□□□ 1.85
UBXN6-206ENST00000590466 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.6■■□□□ 1.85
UBXN6-206ENST00000590466 ZPR1O75312 459 aa26.59■■□□□ 1.85
UBXN6-206ENST00000590466 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.59■■□□□ 1.85
UBXN6-206ENST00000590466 TM4SF1P30408 202 aa26.58■■□□□ 1.85
UBXN6-206ENST00000590466 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.58■■□□□ 1.85
UBXN6-206ENST00000590466 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 A0A087WZG4 1122 aa26.56■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26.56■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 APAF1O14727 1248 aa26.56■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 DDR1Q08345 913 aa26.56■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 NBPF26B4DH59 902 aa26.55■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 NBPF15Q8N660 670 aa26.55■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.55■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 MRS2Q9HD23 443 aa26.54■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.54■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 CHL1O00533 1208 aa26.53■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 NFIXQ14938 502 aa26.52■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.52■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.52■■□□□ 1.84
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
UBXN6-206ENST00000590466 CAMTA2O94983 1202 aa26.5■■□□□ 1.83
UBXN6-206ENST00000590466 GPR162Q16538 588 aa26.48■■□□□ 1.83
UBXN6-206ENST00000590466 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.48■■□□□ 1.83
UBXN6-206ENST00000590466 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
UBXN6-206ENST00000590466 TGFB2P61812 414 aa26.47■■□□□ 1.83
UBXN6-206ENST00000590466 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
UBXN6-206ENST00000590466 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.47■■□□□ 1.83
UBXN6-206ENST00000590466 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
UBXN6-206ENST00000590466 SCN7AQ01118 1682 aa26.45■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.45■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.45■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 CFAP44Q96MT7 982 aa26.45■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF853P0CG23 659 aa26.44■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.43■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 SERPINB2P05120 415 aa26.43■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 ERBB4Q15303 1308 aa26.41■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 A0A0G2JLW4 131 aa26.41■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 RGL2O15211 777 aa26.41■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 KRT24Q2M2I5 525 aa26.41■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.41■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.41■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.41■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 DPEP1P16444 411 aa26.4■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 KCNA3P22001 575 aa26.4■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 PDIA6Q15084 440 aa26.4■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 CCDC27Q2M243 656 aa26.4■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.4■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 MBIPQ9NS73 344 aa26.4■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 BCORQ6W2J9 1755 aa26.39■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 IFT57Q9NWB7 429 aa26.39■■□□□ 1.82
UBXN6-206ENST00000590466 GRIN3BO60391 1043 aa26.38■■□□□ 1.81
UBXN6-206ENST00000590466 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
UBXN6-206ENST00000590466 MYL6BP14649 208 aa26.37■■□□□ 1.81
UBXN6-206ENST00000590466 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
UBXN6-206ENST00000590466 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.37■■□□□ 1.81
UBXN6-206ENST00000590466 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.36■■□□□ 1.81
UBXN6-206ENST00000590466 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.36■■□□□ 1.81
UBXN6-206ENST00000590466 YY1P25490 414 aa26.36■■□□□ 1.81
UBXN6-206ENST00000590466 GNAI1P63096 354 aa26.36■■□□□ 1.81
UBXN6-206ENST00000590466 HLFQ16534 295 aa26.36■■□□□ 1.81
UBXN6-206ENST00000590466 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.36■■□□□ 1.81
UBXN6-206ENST00000590466 NGEFQ8N5V2 710 aa26.36■■□□□ 1.81
UBXN6-206ENST00000590466 SETDB2Q96T68 719 aa26.36■■□□□ 1.81
UBXN6-206ENST00000590466 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
UBXN6-206ENST00000590466 HOXB7P09629 217 aa26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms